Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AAD4 Date Thu Jan 5 11:12:36 GMT 2012 Unique Job ID 7077d9a850922332

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	N	R	T	L	G	S	V	F	I	V	A	G	T	T	I	G	A	G	M	L	A	M	P	L	A	A	A	G	V	G	F	S	V	T	L	I	L	L	I	G	L	W	A	L	M	C	Y	T	A	L	L	L	L	E	V	Y	Q	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																										?	?	?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	P	A	D	T	G	L	G	T	L	A	K	R	Y	L	G	R	Y	G	Q	W	L	T	G	F	S	M	M	F	L	M	Y	A	L	T	A	A	Y	I	S	G	A	G	E	L	L	A	S	S	I	S	D	W	T	G	I	S	M	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	A	G	V	L	L	F	T	F	V	A	G	G	V	V	C	V	G	T	S	L	V	D	L	F	N	R	F	L	F	S	A	K	I	I	F	L	V	V	M	L	V	L	L	L	P	H	I	H	K	V	N	L	L	T	L	P	L	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?		?	?																																			?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	L	A	L	S	A	I	P	V	I	F	T	S	F	G	F	H	G	S	V	P	S	I	V	S	Y	M	D	G	N	I	R	K	L	R	W	V	F	I	I	G	S	A	I	P	L	V	A	Y	I	F	W	Q	V	A	T	L	G	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	S	T	T	F	M	G	L	L	A	N	H	A	G	L	N	G	L	L	Q	A	L	R	E	M	V	A	S	P	H	V	E	L	A	V	H	L	F	A	D	L	A	L	A	T	S	F	L	G	V	A	L	G	L	F	D	Y	L	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	F	Q	R	S	N	T	V	G	G	R	L	Q	T	G	A	I	T	F	L	P	P	L	A	F	A	L	F	Y	P	R	G	F	V	M	A	L	G	Y	A	G	V	A	L	A	V	L	A	L	I	I	P	S	L	L	T	W	Q	S	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?		?	?	?	?																																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Sequence		K	H	N	P	Q	A	G	Y	R	V	K	G	G	R	P	A	L	V	V	V	F	L	C	G	I	A	V	I	G	V	Q	F	L	I	A	A	G	L	L	P	E	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand