Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33195 Date Thu Jan 5 11:51:15 GMT 2012 Unique Job ID 7043e336a2c025a2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	Q	T	L	S	Q	L	E	N	S	G	A	F	I	E	R	H	I	G	P	D	A	A	Q	Q	Q	E	M	L	N	A	V	G	A	Q	S	L	N	A	L	T	G	Q	I	V	P	K	D	I	Q	L	A	T	P	P	Q	V	G	A
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SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	A	T	E	Y	A	A	L	A	E	L	K	A	I	A	S	R	N	K	R	F	T	S	Y	I	G	M	G	Y	T	A	V	Q	L	P	P	V	I	L	R	N	M	L	E	N	P	G	W	Y	T	A	Y	T	P	Y	Q	P	E	V	S
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	G	R	L	E	A	L	L	N	F	Q	Q	V	T	L	D	L	T	G	L	D	M	A	S	A	S	L	L	D	E	A	T	A	A	A	E	A	M	A	M	A	K	R	V	S	K	L	K	N	A	N	R	F	F	V	A	S	D	V	H
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Disorder																														?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	Q	T	L	D	V	V	R	T	R	A	E	T	F	G	F	E	V	I	V	D	D	A	Q	K	V	L	D	H	Q	D	V	F	G	V	L	L	Q	Q	V	G	T	T	G	E	I	H	D	Y	T	A	L	I	S	E	L	K	S	R	K
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	V	V	S	V	A	A	D	I	M	A	L	V	L	L	T	A	P	G	K	Q	G	A	D	I	V	F	G	S	A	Q	R	F	G	V	P	M	G	Y	G	G	P	H	A	A	F	F	A	A	K	D	E	Y	K	R	S	M	P	G	R
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	I	G	V	S	K	D	A	A	G	N	T	A	L	R	M	A	M	Q	T	R	E	Q	H	I	R	R	E	K	A	N	S	N	I	C	T	S	Q	V	L	L	A	N	I	A	S	L	Y	A	V	Y	H	G	P	V	G	L	K	R	I
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Disorder		?		?	?		?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	N	R	I	H	R	L	T	D	I	L	A	A	G	L	Q	Q	K	G	L	K	L	R	H	A	H	Y	F	D	T	L	C	V	E	V	A	D	K	A	G	V	L	T	R	A	E	A	A	E	I	N	L	R	S	D	I	L	N	A	V
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Disorder																																							?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	I	T	L	D	E	T	T	T	R	E	N	V	M	Q	L	F	N	V	L	L	G	D	N	H	G	L	D	I	D	T	L	D	K	D	V	A	H	D	S	R	S	I	Q	P	A	M	L	R	D	D	E	I	L	T	H	P	V	F	N
Secondary structure
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Disorder																						?	?	?	?	?	?						?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?		?
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Sequence		R	Y	H	S	E	T	E	M	M	R	Y	M	H	S	L	E	R	K	D	L	A	L	N	Q	A	M	I	P	L	G	S	C	T	M	K	L	N	A	A	A	E	M	I	P	I	T	W	P	E	F	A	E	L	H	P	F	C	P	P	E
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Disorder		?																						?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Q	A	E	G	Y	Q	Q	M	I	A	Q	L	A	D	W	L	V	K	L	T	G	Y	D	A	V	C	M	Q	P	N	S	G	A	Q	G	E	Y	A	G	L	L	A	I	R	H	Y	H	E	S	R	N	E	G	H	R	D	I	C	L	I
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		P	A	S	A	H	G	T	N	P	A	S	A	H	M	A	G	M	Q	V	V	V	V	A	C	D	K	N	G	N	I	D	L	T	D	L	R	A	K	A	E	Q	A	G	D	N	L	S	C	I	M	V	T	Y	P	S	T	H	G	V	Y
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	E	T	I	R	E	V	C	E	V	V	H	Q	F	G	G	Q	V	Y	L	D	G	A	N	M	N	A	Q	V	G	I	T	S	P	G	F	I	G	A	D	V	S	H	L	N	L	H	K	T	F	C	I	P	H	G	G	G	G	P	G
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		M	G	P	I	G	V	K	A	H	L	A	P	F	V	P	G	H	S	V	V	Q	I	E	G	M	L	T	R	Q	G	A	V	S	A	A	P	F	G	S	A	S	I	L	P	I	S	W	M	Y	I	R	M	M	G	A	E	G	L	K	K
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		A	S	Q	V	A	I	L	N	A	N	Y	I	A	S	R	L	Q	D	A	F	P	V	L	Y	T	G	R	D	G	R	V	A	H	E	C	I	L	D	I	R	P	L	K	E	E	T	G	I	S	E	L	D	I	A	K	R	L	I	D	Y
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Disorder																																													?			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		G	F	H	A	P	T	M	S	F	P	V	A	G	T	L	M	V	E	P	T	E	S	E	S	K	V	E	L	D	R	F	I	D	A	M	L	A	I	R	A	E	I	D	Q	V	K	A	G	V	W	P	L	E	D	N	P	L	V	N	A
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	H	I	Q	S	E	L	V	A	E	W	A	H	P	Y	S	R	E	V	A	V	F	P	A	G	V	A	D	K	Y	W	P	T	V	K	R	L	D	D	V	Y	G	D	R	N	L	F	C	S	C	V	P	I	S	E	Y	Q
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