Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P00550 Date Thu Jan 5 10:56:43 GMT 2012 Unique Job ID 7017ae0785c3d273

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	D	I	K	I	K	V	Q	S	F	G	R	F	L	S	N	M	V	M	P	N	I	G	A	F	I	A	W	G	I	I	T	A	L	F	I	P	T	G	W	L	P	N	E	T	L	A	K	L	V	G	P	M	I	T	Y	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?															?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	L	L	I	G	Y	T	G	G	K	L	V	G	G	E	R	G	G	V	V	G	A	I	T	T	M	G	V	I	V	G	A	D	M	P	M	F	L	G	S	M	I	A	G	P	L	G	G	W	C	I	K	H	F	D	R	W	V	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	I	K	S	G	F	E	M	L	V	N	N	F	S	A	G	I	I	G	M	I	L	A	I	L	A	F	L	G	I	G	P	I	V	E	A	L	S	K	M	L	A	A	G	V	N	F	M	V	V	H	D	M	L	P	L	A	S	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	E	P	A	K	I	L	F	L	N	N	A	I	N	H	G	I	F	S	P	L	G	I	Q	Q	S	H	E	L	G	K	S	I	F	F	L	I	E	A	N	P	G	P	G	M	G	V	L	L	A	Y	M	F	F	G	R	G	S	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?										?	?														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	S	A	G	G	A	A	I	I	H	F	L	G	G	I	H	E	I	Y	F	P	Y	V	L	M	N	P	R	L	I	L	A	V	I	L	G	G	M	T	G	V	F	T	L	T	I	L	G	G	G	L	V	S	P	A	S	P	G	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?																																															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	V	L	A	M	T	P	K	G	A	Y	F	A	N	I	A	G	V	C	A	A	M	A	V	S	F	V	V	S	A	I	L	L	K	T	S	K	V	K	E	E	D	D	I	E	A	A	T	R	R	M	Q	D	M	K	A	E	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	A	S	P	L	S	A	G	D	V	T	N	D	L	S	H	V	R	K	I	I	V	A	C	D	A	G	M	G	S	S	A	M	G	A	G	V	L	R	K	K	I	Q	D	A	G	L	S	Q	I	S	V	T	N	S	A	I	N	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?							?	?			?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	P	D	V	D	L	V	I	T	H	R	D	L	T	E	R	A	M	R	Q	V	P	Q	A	Q	H	I	S	L	T	N	F	L	D	S	G	L	Y	T	S	L	T	E	R	L	V	A	A	Q	R	H	T	A	N	E	E	K	V	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?													?	?	?	?	?	?	?												?				?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	L	K	D	S	F	D	D	S	S	A	N	L	F	K	L	G	A	E	N	I	F	L	G	R	K	A	A	T	K	E	E	A	I	R	F	A	G	E	Q	L	V	K	G	G	Y	V	E	P	E	Y	V	Q	A	M	L	D	R	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?		?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	T	P	T	Y	L	G	E	S	I	A	V	P	H	G	T	V	E	A	K	D	R	V	L	K	T	G	V	V	F	C	Q	Y	P	E	G	V	R	F	G	E	E	E	D	D	I	A	R	L	V	I	G	I	A	A	R	N	N	E	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?																																		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	Q	V	I	T	S	L	T	N	A	L	D	D	E	S	V	I	E	R	L	A	H	T	T	S	V	D	E	V	L	E	L	L	A	G	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand