Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P07102 Date Thu Jan 5 11:00:08 GMT 2012 Unique Job ID 6fa11ac28930314e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	A	I	L	I	P	F	L	S	L	L	I	P	L	T	P	Q	S	A	F	A	Q	S	E	P	E	L	K	L	E	S	V	V	I	V	S	R	H	G	V	R	A	P	T	K	A	T	Q	L	M	Q	D	V	T	P	D	A	W	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	W	P	V	K	L	G	W	L	T	P	R	G	G	E	L	I	A	Y	L	G	H	Y	Q	R	Q	R	L	V	A	D	G	L	L	A	K	K	G	C	P	Q	S	G	Q	V	A	I	I	A	D	V	D	E	R	T	R	K	T	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	F	A	A	G	L	A	P	D	C	A	I	T	V	H	T	Q	A	D	T	S	S	P	D	P	L	F	N	P	L	K	T	G	V	C	Q	L	D	N	A	N	V	T	D	A	I	L	S	R	A	G	G	S	I	A	D	F	T	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	Q	T	A	F	R	E	L	E	R	V	L	N	F	P	Q	S	N	L	C	L	K	R	E	K	Q	D	E	S	C	S	L	T	Q	A	L	P	S	E	L	K	V	S	A	D	N	V	S	L	T	G	A	V	S	L	A	S	M	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?		?	?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	I	F	L	L	Q	Q	A	Q	G	M	P	E	P	G	W	G	R	I	T	D	S	H	Q	W	N	T	L	L	S	L	H	N	A	Q	F	Y	L	L	Q	R	T	P	E	V	A	R	S	R	A	T	P	L	L	D	L	I	K	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	T	P	H	P	P	Q	K	Q	A	Y	G	V	T	L	P	T	S	V	L	F	I	A	G	H	D	T	N	L	A	N	L	G	G	A	L	E	L	N	W	T	L	P	G	Q	P	D	N	T	P	P	G	G	E	L	V	F	E	R	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	R	L	S	D	N	S	Q	W	I	Q	V	S	L	V	F	Q	T	L	Q	Q	M	R	D	K	T	P	L	S	L	N	T	P	P	G	E	V	K	L	T	L	A	G	C	E	E	R	N	A	Q	G	M	C	S	L	A	G	F	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?										?		?	?	?	?		?			?	?					?	?	?	?												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Sequence		I	V	N	E	A	R	I	P	A	C	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand