Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P21345 Date Thu Jan 5 11:38:04 GMT 2012 Unique Job ID 6d69d8d5fdc8356f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	N	I	K	F	S	L	A	W	Q	I	L	F	A	M	V	L	G	I	L	L	G	S	Y	L	H	Y	H	S	D	S	R	D	W	L	V	V	N	L	L	S	P	A	G	D	I	F	I	H	L	I	K	M	I	V	V	P	I	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																								?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	S	T	L	V	V	G	I	A	G	V	G	D	A	K	Q	L	G	R	I	G	A	K	T	I	I	Y	F	E	V	I	T	T	V	A	I	I	L	G	I	T	L	A	N	V	F	Q	P	G	A	G	V	D	M	S	Q	L	A	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	I	S	K	Y	Q	S	T	T	E	A	V	Q	S	S	S	H	G	I	M	G	T	I	L	S	L	V	P	T	N	I	V	A	S	M	A	K	G	E	M	L	P	I	I	F	F	S	V	L	F	G	L	G	L	S	S	L	P	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		H	R	E	P	L	V	T	V	F	R	S	I	S	E	T	M	F	K	V	T	H	M	V	M	R	Y	A	P	V	G	V	F	A	L	I	A	V	T	V	A	N	F	G	F	S	S	L	W	P	L	A	K	L	V	L	L	V	H	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	L	F	F	A	L	V	V	L	G	I	V	A	R	L	C	G	L	S	V	W	I	L	I	R	I	L	K	D	E	L	I	L	A	Y	S	T	A	S	S	E	S	V	L	P	R	I	I	E	K	M	E	A	Y	G	A	P	V	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	S	F	V	V	P	T	G	Y	S	F	N	L	D	G	S	T	L	Y	Q	S	I	A	A	I	F	I	A	Q	L	Y	G	I	D	L	S	I	W	Q	E	I	I	L	V	L	T	L	M	V	T	S	K	G	I	A	G	V	P	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	F	V	V	L	L	A	T	L	G	S	V	G	I	P	L	E	G	L	A	F	I	A	G	V	D	R	I	L	D	M	A	R	T	A	L	N	V	V	G	N	A	L	A	V	L	V	I	A	K	W	E	H	K	F	D	R	K	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?																																									?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	A	Y	E	R	E	V	L	G	K	F	D	K	T	A	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand