Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P40120 Date Thu Jan 5 12:01:11 GMT 2012 Unique Job ID 6ccdd1af2a472a65

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	R	R	R	F	I	K	G	S	M	A	M	A	A	V	C	G	T	S	G	I	A	S	L	F	S	Q	A	A	F	A	A	D	S	D	I	A	D	G	Q	T	Q	R	F	D	F	S	I	L	Q	S	M	A	H	D	L	A	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?							?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?
Disorder confidence
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Sequence		A	W	R	G	A	P	R	P	L	P	D	T	L	A	T	M	T	P	Q	A	Y	N	S	I	Q	Y	D	A	E	K	S	L	W	H	N	V	E	N	R	Q	L	D	A	Q	F	F	H	M	G	M	G	F	R	R	R	V	R	M	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																						?				?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	D	P	A	T	H	L	A	R	E	I	H	F	R	P	E	L	F	K	Y	N	D	A	G	V	D	T	K	Q	L	E	G	Q	S	D	L	G	F	A	G	F	R	V	F	K	A	P	E	L	A	R	R	D	V	V	S	F	L	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?		?						?					?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	Y	F	R	A	V	D	D	T	Y	Q	Y	G	L	S	A	R	G	L	A	I	D	T	Y	T	D	S	K	E	E	F	P	D	F	T	A	F	W	F	D	T	V	K	P	G	A	T	T	F	T	V	Y	A	L	L	D	S	A	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?											?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	G	A	Y	K	F	T	I	H	C	E	K	S	Q	V	I	M	D	V	E	N	H	L	Y	A	R	K	D	I	K	Q	L	G	I	A	P	M	T	S	M	F	S	C	G	T	N	E	R	R	M	C	D	T	I	H	P	Q	I	H	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	D	R	L	S	M	W	R	G	N	G	E	W	I	C	R	P	L	N	N	P	Q	K	L	Q	F	N	A	Y	T	D	N	N	P	K	G	F	G	L	L	Q	L	D	R	D	F	S	H	Y	Q	D	I	M	G	W	Y	N	K	R	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?							?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	L	W	V	E	P	R	N	K	W	G	K	G	T	I	G	L	M	E	I	P	T	T	G	E	T	L	D	N	I	V	C	F	W	Q	P	E	K	A	V	K	A	G	D	E	F	A	F	Q	Y	R	L	Y	W	S	A	Q	P	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	C	P	L	A	R	V	M	A	T	R	T	G	M	G	G	F	S	E	G	W	A	P	G	E	H	Y	P	E	K	W	A	R	R	F	A	V	D	F	V	G	G	D	L	K	A	A	A	P	K	G	I	E	P	V	I	T	L	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		G	E	A	K	Q	I	E	I	L	Y	I	E	P	I	D	G	Y	R	I	Q	F	D	W	Y	P	T	S	D	S	T	D	P	V	D	M	R	M	Y	L	R	C	Q	G	D	A	I	S	E	T	W	L	Y	Q	Y	F	P	P	A	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Sequence		K	R	Q	Y	V	D	D	R	V	M	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand