Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77239 Date Thu Jan 5 12:26:42 GMT 2012 Unique Job ID 6c19613c04be8e05

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	I	A	L	I	I	G	S	M	I	A	G	G	I	I	S	A	A	G	F	T	W	V	A	K	A	E	P	P	A	E	K	T	S	T	A	E	R	K	I	L	F	W	Y	D	P	M	Y	P	N	T	R	F	D	K	P	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	P	F	M	D	M	D	L	V	P	K	Y	A	D	E	E	S	S	A	S	G	V	R	I	D	P	T	Q	T	Q	N	L	G	V	K	T	A	T	V	T	R	G	P	L	T	F	A	Q	S	F	P	A	N	V	S	Y	N	E	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?				?					?	?			?					?		?	?	?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	A	I	V	Q	A	R	A	A	G	F	I	D	K	V	Y	P	L	T	V	G	D	K	V	Q	K	G	T	P	L	L	D	L	T	I	P	D	W	V	E	A	Q	S	E	Y	L	L	L	R	E	T	G	G	T	A	T	Q	T	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	L	E	R	L	R	L	A	G	M	P	E	A	D	I	R	R	L	I	A	T	Q	K	I	Q	T	R	F	T	L	K	A	P	I	D	G	V	I	T	A	F	D	L	R	A	G	M	N	I	A	K	D	N	V	V	A	K	I	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?											?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	D	P	V	W	V	T	A	A	I	P	E	S	I	A	W	L	V	K	D	A	S	Q	F	T	L	T	V	P	A	R	P	D	K	T	L	T	I	R	K	W	T	L	L	P	G	V	D	A	A	T	R	T	L	Q	L	R	L	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	N	A	D	E	A	L	K	P	G	M	N	A	W	L	Q	L	N	T	A	S	E	P	M	L	L	I	P	S	Q	A	L	I	D	T	G	S	E	Q	R	V	I	T	V	D	A	D	G	R	F	V	P	K	R	V	A	V	F	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	Q	G	V	T	A	L	R	S	G	L	A	E	G	E	K	V	V	S	S	G	L	F	L	I	D	S	E	A	N	I	S	G	A	L	E	R	M	R	S	E	S	A	T	H	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand