Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76162 Date Thu Jan 5 12:19:57 GMT 2012 Unique Job ID 6bcbd13fd902e966

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	V	L	L	R	P	V	L	V	P	E	L	G	L	V	V	L	K	P	G	R	E	S	I	Q	I	F	H	N	P	R	V	L	V	E	P	E	P	K	S	M	R	N	L	P	S	G	V	V	P	A	V	R	Q	P	L	A	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?							?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	T	L	L	P	F	F	S	N	E	R	V	I	R	A	A	G	G	V	G	A	L	S	D	W	L	L	R	H	V	T	S	C	Q	W	P	N	G	D	Y	H	H	T	E	T	V	I	H	R	Y	G	T	G	A	M	V	L	C	W	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		C	D	N	Q	L	R	D	Q	T	S	E	S	L	E	L	L	A	Q	Q	N	L	T	A	W	V	I	D	V	I	R	H	A	I	S	G	T	Q	E	R	E	L	S	L	A	E	L	S	W	W	A	V	C	N	Q	V	V	D	A	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?																								?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	A	V	S	R	R	S	L	G	L	P	A	E	K	I	C	S	V	Y	R	E	S	D	I	V	P	G	E	L	T	A	T	S	I	L	K	Q	R	T	K	N	L	A	P	L	P	Y	A	H	Q	Q	Q	K	S	P	Q	E	K	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?					?				?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	S	I	T	V	D	P	E	S	P	E	S	F	M	K	L	P	K	R	R	R	W	V	K	E	K	Y	T	R	W	V	K	T	Q	P	C	A	C	C	G	M	P	A	D	D	P	H	H	L	I	G	H	G	Q	G	G	M	G	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?		?					?					?	?	?	?	?	?	?	?		?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		A	H	D	L	F	V	L	P	L	C	R	K	H	H	N	E	L	H	T	D	T	V	A	F	E	D	K	Y	G	S	Q	L	E	L	I	F	R	F	I	D	R	A	L	A	I	G	V	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																		?	?																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand