Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0CK95 Date Wed Jan 25 15:20:37 GMT 2012 Unique Job ID 6ba547f08901501c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	K	F	K	Y	K	K	S	L	L	A	A	I	L	S	A	T	L	L	A	G	C	D	G	G	G	S	G	S	S	S	D	T	P	P	V	D	S	G	T	G	S	L	P	E	V	K	P	D	P	T	P	N	P	E	P	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	P	T	P	D	P	E	P	T	P	E	P	I	P	D	P	E	P	T	P	E	P	E	P	E	P	V	P	T	K	T	G	Y	L	T	L	G	G	S	Q	R	V	T	G	A	T	C	N	G	E	S	S	D	G	F	T	F	K	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	D	V	T	C	V	A	G	N	T	T	I	A	T	F	N	T	Q	S	E	A	A	R	S	L	R	A	V	E	K	V	S	F	S	L	E	D	A	Q	E	L	A	G	S	D	D	K	K	S	N	A	V	S	L	V	T	S	S	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?			?	?	?	?		?	?	?										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	P	A	N	T	E	Q	V	C	L	T	F	S	S	V	I	E	S	K	R	F	D	S	L	Y	K	Q	I	D	L	A	P	E	E	F	K	K	L	V	N	E	E	V	E	N	N	A	A	T	D	K	A	P	S	T	H	T	S	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?										?				?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	P	V	T	T	P	G	T	K	P	D	L	N	A	S	F	V	S	A	N	A	E	Q	F	Y	Q	Y	Q	P	T	E	I	I	L	S	E	G	R	L	V	D	S	Q	G	Y	G	V	A	G	V	N	Y	Y	T	N	S	G	R	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?		?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	G	E	N	G	E	F	S	F	S	W	G	E	T	I	S	F	G	I	D	T	F	E	L	G	S	V	R	G	N	K	S	T	I	A	L	T	E	L	G	D	E	V	R	G	A	N	I	D	Q	L	I	H	R	Y	S	T	T	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																									?											?		?		?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	N	T	R	V	V	P	D	D	V	R	K	V	F	A	E	Y	P	N	V	I	N	E	I	I	N	L	S	L	S	N	G	A	T	L	G	E	G	E	Q	V	V	N	L	P	N	E	F	I	E	Q	F	N	T	G	Q	A	K	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	T	A	I	C	A	K	T	D	G	C	N	E	A	R	W	F	S	L	T	T	R	N	V	N	D	G	Q	I	Q	G	V	I	N	K	L	W	G	V	D	T	N	Y	K	S	V	S	K	F	H	V	F	H	D	S	T	N	F	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	T	G	N	A	R	G	Q	A	V	V	N	I	S	N	A	A	F	P	I	L	M	A	R	N	D	K	N	Y	W	L	A	F	G	E	K	R	A	W	D	K	N	E	L	A	Y	I	T	E	A	P	S	L	V	E	P	E	N	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																					?		?											?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	D	T	A	T	F	N	L	P	F	I	S	L	G	Q	V	G	E	G	K	L	M	V	I	G	N	P	H	Y	N	S	I	L	R	C	P	N	G	Y	S	W	N	G	G	V	N	K	D	G	Q	C	T	L	N	S	D	P	D	D	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?										?	?		?																										?	?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		K	N	F	M	E	N	V	L	R	Y	L	S	D	D	K	W	K	P	D	A	K	A	S	M	T	V	G	T	N	L	D	T	V	Y	F	K	R	H	G	Q	V	T	G	N	S	A	A	F	D	F	H	P	D	F	A	G	I	S	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?		?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		H	L	S	S	Y	G	D	L	D	P	Q	E	M	P	L	L	I	L	N	G	F	E	Y	V	T	Q	V	G	N	D	P	Y	A	I	P	L	R	A	D	T	S	K	P	K	L	T	Q	Q	D	V	T	D	L	I	A	Y	L	N	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?	?	?	?		?									?			?	?	?	?	?	?	?			?							?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		G	S	V	L	I	M	E	N	V	M	S	N	L	K	E	E	S	A	S	G	F	V	R	L	L	D	A	A	G	L	S	M	A	L	N	K	S	V	V	N	N	D	P	Q	G	Y	P	N	R	V	R	Q	Q	R	A	T	G	I	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?																				?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Y	E	R	Y	P	A	V	D	G	A	L	P	Y	T	I	D	S	K	T	G	E	V	K	W	K	Y	Q	V	E	N	K	P	D	D	K	P	K	L	E	V	A	S	W	L	E	D	V	D	G	K	Q	E	T	R	Y	A	F	I	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?		?	?										?		?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		A	D	H	K	T	E	D	S	L	K	A	A	K	E	K	I	F	A	A	F	P	G	L	K	E	C	T	N	P	A	Y	H	Y	E	V	N	C	L	E	Y	R	P	G	T	G	V	P	V	T	G	G	M	Y	V	P	Q	Y	T	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?																																								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		S	L	N	A	D	T	A	K	A	M	V	Q	A	A	D	L	G	T	N	I	Q	R	L	Y	Q	H	E	L	Y	F	R	T	N	G	R	K	G	E	R	L	S	S	V	D	L	E	R	L	Y	Q	N	M	S	V	W	L	W	N	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?															?	?		?	?	?	?	?	?	?	?				?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		S	Y	R	Y	E	E	G	K	N	D	E	L	G	F	K	T	F	T	E	F	L	N	C	Y	A	N	D	A	Y	A	G	G	T	K	C	S	A	D	L	K	K	S	L	V	D	N	N	M	I	Y	G	D	G	S	S	K	A	G	M	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?		?		?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		N	P	S	Y	P	L	N	Y	M	E	K	P	L	T	R	L	M	L	G	R	S	W	W	D	L	N	I	K	V	D	V	E	K	Y	P	G	A	V	S	E	E	G	Q	N	V	T	E	T	I	S	L	Y	S	N	P	T	K	W	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		G	N	M	Q	S	T	G	L	W	A	P	A	Q	K	E	V	T	I	K	S	N	A	N	V	P	V	T	V	T	V	A	L	A	D	D	L	T	G	R	E	K	H	E	V	A	L	N	R	P	P	R	V	T	K	T	Y	S	L	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																						?	?	?													?	?	?	?	?	?		?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		S	G	T	V	K	F	K	V	P	Y	G	G	L	I	Y	I	K	G	N	S	S	T	N	E	S	A	S	F	T	F	T	G	V	V	K	A	P	F	Y	K	D	G	A	W	K	N	D	L	N	S	P	A	P	L	G	E	L	E	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		A	F	V	Y	T	T	P	K	K	N	L	N	A	S	N	Y	T	G	G	L	E	Q	F	A	N	D	L	D	T	F	A	S	S	M	N	D	F	Y	G	R	D	S	E	D	G	K	H	R	M	F	T	Y	K	N	L	P	G	H	K	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?																															?	?		?		?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		R	F	T	N	D	V	Q	I	S	I	G	D	A	H	S	G	Y	P	V	M	N	S	S	F	S	P	N	S	T	T	L	P	T	T	P	L	N	D	W	L	I	W	H	E	V	G	H	N	A	A	E	T	P	L	T	V	P	G	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?						?	?		?	?																?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		E	V	A	N	N	V	L	A	L	Y	M	Q	D	R	Y	L	G	K	M	N	R	V	A	D	D	I	T	V	A	P	E	Y	L	E	E	S	N	N	Q	A	W	A	R	G	G	A	G	D	R	L	L	M	Y	A	Q	L	K	E	W	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?		?	?	?	?		?									?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		E	K	N	F	D	I	K	K	W	Y	P	D	G	T	P	L	P	E	F	Y	S	E	R	E	G	M	K	G	W	N	L	F	Q	L	M	H	R	K	A	R	G	D	E	V	S	N	D	K	F	G	G	K	N	Y	C	A	E	S	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence		N	A	A	D	T	L	M	L	C	A	S	W	V	A	Q	T	D	L	S	E	F	F	K	K	W	N	P	G	A	N	A	Y	Q	L	P	G	A	S	E	M	S	F	E	G	G	V	S	Q	S	A	Y	N	T	L	A	S	L	D	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?				?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520
Sequence		K	P	E	Q	G	P	E	T	I	N	Q	V	T	E	H	K	M	S	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?												?	?	?	?	?	?	?	?
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