Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P66948 Date Thu Jan 5 12:10:22 GMT 2012 Unique Job ID 6b6413d4b4ecc346

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	R	Q	L	K	K	N	L	V	A	T	L	I	A	A	M	T	I	G	Q	V	A	P	A	F	A	D	S	A	D	T	L	P	D	M	G	T	S	A	G	S	T	L	S	I	G	Q	E	M	Q	M	G	D	Y	Y	V	R	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																						?	?		?			?	?	?	?		?	?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	G	S	A	P	L	I	N	D	P	L	L	T	Q	Y	I	N	S	L	G	M	R	L	V	S	H	A	N	S	V	K	T	P	F	H	F	F	L	I	N	N	D	E	I	N	A	F	A	F	F	G	G	N	V	V	L	H	S	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	R	Y	S	D	N	E	S	Q	L	A	S	V	M	A	H	E	I	S	H	V	T	Q	R	H	L	A	R	A	M	E	D	Q	Q	R	S	A	P	L	T	W	V	G	A	L	G	S	I	L	L	A	M	A	S	P	Q	A	G	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	L	T	G	T	L	A	G	T	R	Q	G	M	I	S	F	T	Q	Q	N	E	Q	E	A	D	R	I	G	I	Q	V	L	Q	R	S	G	F	D	P	Q	A	M	P	T	F	L	E	K	L	L	D	Q	A	R	Y	S	S	R	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?		?																																					?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	I	L	L	T	H	P	L	P	E	S	R	L	A	D	A	R	N	R	A	N	Q	M	R	P	M	V	V	Q	S	S	E	D	F	Y	L	A	K	A	R	T	L	G	M	Y	N	S	G	R	N	Q	L	T	S	D	L	L	D	E	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?		?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	K	G	N	V	R	Q	Q	R	A	A	Q	Y	G	R	A	L	Q	A	M	E	A	N	K	Y	D	E	A	R	K	T	L	Q	P	L	L	A	A	E	P	G	N	A	W	Y	L	D	L	A	T	D	I	D	L	G	Q	N	K	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?														?	?	?																																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	A	I	N	R	L	K	N	A	R	D	L	R	T	N	P	V	L	Q	L	N	L	A	N	A	Y	L	Q	G	G	Q	P	Q	E	A	A	N	I	L	N	R	Y	T	F	N	N	K	D	D	S	N	G	W	D	L	L	A	Q	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	A	L	N	N	R	D	Q	E	L	A	A	R	A	E	G	Y	A	L	A	G	R	L	D	Q	A	I	S	L	L	S	S	A	S	S	Q	V	K	L	G	S	L	Q	Q	A	R	Y	D	A	R	I	D	Q	L	R	Q	L	Q	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		F	K	P	Y	T	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand