Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P15977 Date Thu Jan 5 11:34:58 GMT 2012 Unique Job ID 6aef0415fcf9c303

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	K	R	L	D	N	A	A	L	A	A	G	I	S	P	N	Y	I	N	A	H	G	K	P	Q	S	I	S	A	E	T	K	R	R	L	L	D	A	M	H	Q	R	T	A	T	K	V	A	V	T	P	V	P	N	V	M	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	S	G	K	K	M	P	M	V	V	E	G	S	G	E	Y	S	W	L	L	T	T	E	E	G	T	Q	Y	K	G	H	V	T	G	G	K	A	F	N	L	P	T	K	L	P	E	G	Y	H	T	L	T	L	T	Q	D	D	Q	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		H	C	R	V	I	V	A	P	K	R	C	Y	E	P	Q	A	L	L	N	K	Q	K	L	W	G	A	C	V	Q	L	Y	T	L	R	S	E	K	N	W	G	I	G	D	F	G	D	L	K	A	M	L	V	D	V	A	K	R	G	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?		?	?	?	?	?	?														?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	I	G	L	N	P	I	H	A	L	Y	P	A	N	P	E	S	A	S	P	Y	S	P	S	S	R	R	W	L	N	V	I	Y	I	D	V	N	A	V	E	D	F	H	L	S	E	E	A	Q	A	W	W	Q	L	P	T	T	Q	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?																																					?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	Q	Q	A	R	D	A	D	W	V	D	Y	S	T	V	T	A	L	K	M	T	A	L	R	M	A	W	K	G	F	A	Q	R	D	D	E	Q	M	A	A	F	R	Q	F	V	A	E	Q	G	D	S	L	F	W	Q	A	A	F	D	A
Secondary structure
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Disorder			?	?	?		?																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	H	A	Q	Q	V	K	E	D	E	M	R	W	G	W	P	A	W	P	E	M	Y	Q	N	V	D	S	P	E	V	R	Q	F	C	E	E	H	R	D	D	V	D	F	Y	L	W	L	Q	W	L	A	Y	S	Q	F	A	A	C	W	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	S	Q	G	Y	E	M	P	I	G	L	Y	R	D	L	A	V	G	V	A	E	G	G	A	E	T	W	C	D	R	E	L	Y	C	L	K	A	S	V	G	A	P	P	D	I	L	G	P	L	G	Q	N	W	G	L	P	P	M	D	P
Secondary structure
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Disorder						?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	I	I	T	A	R	A	Y	E	P	F	I	E	L	L	R	A	N	M	Q	N	C	G	A	L	R	I	D	H	V	M	S	M	L	R	L	W	W	I	P	Y	G	E	T	A	D	Q	G	A	Y	V	H	Y	P	V	D	D	L	L	S
Secondary structure
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Disorder							?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	L	A	L	E	S	K	R	H	R	C	M	V	I	G	E	D	L	G	T	V	P	V	E	I	V	G	K	L	R	S	S	G	V	Y	S	Y	K	V	L	Y	F	E	N	D	H	E	K	T	F	R	A	P	K	A	Y	P	E	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		M	A	V	A	A	T	H	D	L	P	T	L	R	G	Y	W	E	C	G	D	L	T	L	G	K	T	L	G	L	Y	P	D	E	V	V	L	R	G	L	Y	Q	D	R	E	L	A	K	Q	G	L	L	D	A	L	H	K	Y	G	C	L
Secondary structure
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Disorder																																			?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		P	K	R	A	G	H	K	A	S	L	M	S	M	T	P	T	L	N	R	G	L	Q	R	Y	I	A	D	S	N	S	A	L	L	G	L	Q	P	E	D	W	L	D	M	A	E	P	V	N	I	P	G	T	S	Y	Q	Y	K	N	W	R
Secondary structure
SS confidence
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Sequence		R	K	L	S	A	T	L	E	S	M	F	A	D	D	G	V	N	K	L	L	K	D	L	D	R	R	R	R	A	A	A	K	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand