Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77172 Date Thu Jan 5 12:25:57 GMT 2012 Unique Job ID 69cb39503e698f80

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	L	N	A	T	Y	I	K	I	R	D	K	W	W	G	L	P	L	F	L	P	S	L	I	L	P	I	F	A	H	I	N	T	F	A	H	I	S	S	G	E	V	F	L	F	Y	L	P	L	A	L	M	I	S	M	M	M	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	W	A	A	L	P	G	I	A	L	G	I	F	V	R	K	Y	A	E	L	G	F	Y	E	T	L	S	L	T	A	N	F	I	I	I	I	I	L	C	W	G	G	Y	R	V	F	T	P	R	R	N	N	V	S	H	G	D	T	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?		?	?																						?		?	?	?					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	S	Q	R	I	F	W	Q	I	V	F	P	A	T	L	F	L	I	L	F	Q	F	A	A	F	V	G	L	L	A	S	R	E	N	L	V	G	V	M	P	F	N	L	G	T	L	I	N	Y	Q	A	L	L	V	G	N	L	I	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	L	C	Y	F	I	I	R	V	V	R	N	P	F	Y	L	R	S	Y	Y	S	Q	L	K	Q	Q	V	D	A	K	V	T	K	K	E	F	A	L	W	L	L	A	L	G	A	L	L	L	L	L	C	M	P	L	N	E	K	S	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?			?	?	?																								?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	S	T	N	Y	T	L	S	L	L	L	P	L	M	M	W	G	A	M	R	Y	G	Y	K	L	I	S	L	L	W	A	V	V	L	M	I	S	I	H	S	Y	Q	N	Y	I	P	I	Y	P	G	Y	T	T	Q	L	T	I	T	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?																																			?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	Y	L	V	F	S	F	I	V	N	Y	M	A	V	L	A	T	R	Q	R	A	V	V	R	R	I	Q	R	L	A	Y	V	D	P	V	V	H	L	P	N	V	R	A	L	N	R	A	L	R	D	A	P	W	S	A	L	C	Y	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	P	G	M	E	M	L	V	K	N	Y	G	I	M	L	R	I	Q	Y	K	Q	K	L	S	H	W	L	S	P	L	L	E	P	G	E	D	V	Y	Q	L	S	G	N	D	L	A	L	R	L	N	T	E	S	H	Q	E	R	I	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	D	S	H	L	K	Q	F	R	F	F	W	D	G	M	P	M	Q	P	Q	I	G	V	S	Y	C	Y	V	R	S	P	V	N	H	I	Y	L	L	L	G	E	L	N	T	V	A	E	L	S	I	V	T	N	A	P	E	N	M	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	G	A	M	Y	L	Q	R	E	L	K	D	K	V	A	M	M	N	R	L	Q	Q	A	L	E	H	N	H	F	F	L	M	A	Q	P	I	T	G	M	R	G	D	V	Y	H	E	I	L	L	R	M	K	G	E	N	D	E	L	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	D	S	F	L	P	V	A	H	E	F	G	L	S	S	S	I	D	M	W	V	I	E	H	T	L	Q	F	M	A	E	N	R	A	K	M	P	A	H	R	F	A	I	N	L	S	P	T	S	V	C	Q	A	R	F	P	V	E	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?			?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	L	L	A	K	Y	Q	I	E	A	W	Q	L	I	F	E	V	T	E	S	N	A	L	T	N	V	K	Q	A	Q	I	T	L	Q	H	L	Q	E	L	G	C	Q	I	A	I	D	D	F	G	T	G	Y	A	S	Y	A	R	L	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	N	A	D	L	L	K	I	D	G	S	F	I	R	N	I	V	S	N	S	L	D	Y	Q	I	V	A	S	I	C	H	L	A	R	M	K	K	M	L	V	V	A	E	Y	V	E	N	E	E	I	R	E	A	V	L	S	L	G	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	M	Q	G	Y	L	I	G	K	P	Q	P	L	I	D	T	L	N	E	I	E	P	I	R	E	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand