Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08369 Date Wed Jan 25 15:20:13 GMT 2012 Unique Job ID 6947354f1d6119b9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	S	P	L	F	W	K	M	T	S	L	F	G	A	V	L	L	L	L	I	P	I	M	L	I	R	Q	V	I	V	E	R	A	D	Y	R	S	D	V	E	D	A	I	R	Q	S	T	S	G	P	Q	K	L	V	G	P	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																									?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	I	P	V	T	E	L	Y	T	V	Q	E	E	D	K	T	V	E	R	K	R	S	F	I	H	F	W	L	P	E	S	L	M	V	D	G	N	Q	N	V	E	E	R	K	I	G	I	Y	T	G	Q	V	W	H	S	D	L	T	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?					?	?			?	?																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	D	F	D	V	S	R	L	S	E	L	N	A	P	N	I	T	L	G	K	P	F	I	V	I	S	V	G	D	A	R	G	I	G	V	V	K	A	P	E	V	N	G	T	A	L	T	I	E	P	G	T	G	L	E	Q	G	G	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?		?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	H	I	P	L	P	E	G	D	W	R	K	Q	N	L	K	L	N	M	A	L	N	L	S	G	T	G	D	L	S	V	V	P	G	G	R	N	S	E	M	T	L	T	S	N	W	P	H	P	S	F	L	G	D	F	L	P	A	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?				?	?												?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	V	S	E	S	G	F	Q	A	H	W	Q	S	S	W	F	A	N	N	L	G	E	R	F	A	S	G	N	D	T	G	W	E	N	F	P	A	F	S	V	A	V	T	T	P	A	D	Q	Y	Q	L	T	D	R	A	T	K	Y	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?								?		?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	L	I	A	L	T	F	M	A	F	F	V	F	E	T	L	T	A	Q	R	L	H	P	M	Q	Y	L	L	V	G	L	S	L	V	M	F	Y	L	L	L	L	A	L	S	E	H	T	G	F	T	V	A	W	I	I	A	S	L	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	I	M	N	G	I	Y	L	Q	A	V	L	K	G	W	C	N	S	M	L	F	T	L	A	L	L	L	L	D	G	V	M	W	G	L	L	N	S	A	D	S	A	L	L	L	G	T	S	V	L	V	V	A	L	A	G	M	M	F	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Sequence		T	R	N	I	D	W	Y	A	F	S	L	P	K	M	K	A	S	K	E	V	T	T	D	D	E	L	R	I	W	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand