Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P69826 Date Thu Jan 5 12:12:09 GMT 2012 Unique Job ID 686b397af55d4a6d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	N	K	S	A	R	A	K	V	Q	A	F	G	G	F	L	T	A	M	V	I	P	N	I	G	A	F	I	A	W	G	F	I	T	A	L	F	I	P	T	G	W	L	P	N	E	H	F	A	K	I	V	G	P	M	I	T	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	P	V	M	I	G	S	T	G	G	H	L	V	G	G	K	R	G	A	V	M	G	G	I	G	T	I	G	V	I	V	G	A	E	I	P	M	F	L	G	S	M	I	M	G	P	L	G	G	L	V	I	K	Y	V	D	K	A	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	R	I	P	A	G	F	E	M	V	I	N	N	F	S	L	G	I	A	G	M	L	L	C	L	L	G	F	E	V	I	G	P	A	V	L	I	A	N	T	F	V	K	E	C	I	E	A	L	V	H	A	G	Y	L	P	L	L	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	N	E	P	A	K	V	L	F	L	N	N	A	I	D	Q	G	V	Y	Y	P	L	G	M	Q	Q	A	S	V	N	G	K	S	I	F	F	M	V	A	S	N	P	G	P	G	L	G	L	L	L	A	F	T	L	F	G	K	G	M	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	R	S	A	P	G	A	M	I	I	H	F	L	G	G	I	H	E	L	Y	F	P	Y	V	L	M	K	P	L	T	I	I	A	M	I	A	G	G	M	S	G	T	W	M	F	N	L	L	D	G	G	L	V	A	G	P	S	P	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	F	A	Y	L	A	L	T	P	K	G	S	F	L	A	T	I	A	G	V	T	V	G	T	L	V	S	F	A	I	T	S	L	I	L	K	M	E	K	T	V	E	T	E	S	E	D	E	F	A	Q	S	A	N	A	V	K	A	M	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	E	G	A	F	S	L	S	R	V	K	R	I	A	F	V	C	D	A	G	M	G	S	S	A	M	G	A	T	T	F	R	K	R	L	E	K	A	G	L	A	I	E	V	K	H	Y	A	I	E	N	V	P	A	D	A	D	I	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?			?	?				?		?															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Sequence		T	H	A	S	L	E	G	R	V	K	R	V	T	D	K	P	L	I	L	I	N	N	Y	I	G	D	P	K	L	D	T	L	F	N	Q	L	T	A	E	H	K	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand