Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46833 Date Thu Jan 5 12:34:58 GMT 2012 Unique Job ID 6858a45ffad35f08

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	H	Q	Q	H	M	R	N	I	A	Q	W	L	Q	E	N	G	I	T	R	A	T	V	A	P	D	W	M	S	I	P	C	G	F	M	A	C	D	A	Q	R	V	I	C	R	I	D	E	C	R	G	W	S	A	G	L	A	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	V	M	F	R	A	Q	L	N	E	Q	D	L	P	L	S	L	T	V	V	G	I	A	P	E	K	L	S	A	W	A	G	A	D	A	E	R	L	T	V	T	A	L	P	A	I	T	T	Y	G	E	P	E	G	N	L	L	T	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?		?	?	?	?	?	?				?		?	?	?	?						?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		W	Q	P	R	V	S	Y	R	K	Q	W	A	R	W	R	V	M	I	L	P	I	L	L	I	L	V	A	L	A	V	E	R	G	V	T	L	W	S	V	S	E	Q	V	A	Q	S	R	T	Q	A	E	E	Q	F	L	T	L	F	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	K	R	I	V	N	L	R	S	Q	V	T	M	A	L	K	K	Y	R	P	Q	A	D	D	T	R	L	L	A	E	L	S	A	I	A	S	T	L	K	S	A	S	L	S	D	I	E	M	R	G	F	T	F	D	Q	K	R	Q	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Sequence		H	L	Q	L	R	A	A	N	F	A	S	F	D	K	L	R	S	V	L	A	T	D	Y	V	V	Q	Q	D	A	L	Q	K	E	G	D	A	V	S	G	G	V	T	L	R	R	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?													?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand