Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76463 Date Thu Jan 5 12:23:09 GMT 2012 Unique Job ID 6828eb533dcc3b3a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	W	R	R	I	V	W	L	L	A	L	V	T	L	P	T	L	A	E	E	T	P	L	Q	L	V	L	R	G	A	Q	H	D	Q	L	Y	Q	L	S	S	S	G	V	T	K	V	S	A	L	P	D	S	L	T	T	P	L	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	W	K	L	Y	V	Y	A	W	L	E	D	T	H	Q	P	E	Q	P	Y	Q	C	R	G	N	S	P	E	E	V	Y	C	C	Q	A	G	E	S	I	T	R	D	T	A	L	V	R	S	C	G	L	Y	F	A	P	Q	R	L	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?				?	?	?	?	?												?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	A	D	V	W	G	Q	Y	W	Q	Q	R	Q	A	P	A	W	L	A	S	L	T	T	L	K	P	E	T	S	V	T	V	K	S	L	L	D	S	L	A	T	L	P	A	Q	N	K	A	Q	E	V	L	L	D	V	V	L	D	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?										?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?											?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	I	G	V	A	S	M	L	G	S	R	V	R	V	K	T	W	S	W	F	A	D	D	K	Q	E	I	R	Q	G	G	F	A	G	W	L	T	D	G	T	P	L	W	V	T	G	S	G	T	S	K	T	V	L	T	R	Y	A	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?					?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	N	R	V	L	P	V	P	T	Q	V	A	S	G	Q	C	V	E	V	E	L	F	A	R	Y	P	L	K	K	I	T	A	E	K	S	T	T	A	V	N	P	G	V	L	N	G	R	Y	R	V	T	F	T	N	G	N	H	I	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	S	H	G	E	T	T	L	L	S	E	K	G	K	L	K	L	Q	S	H	L	D	R	E	E	Y	V	A	R	V	L	D	R	E	A	K	S	T	P	P	E	A	A	K	A	M	T	V	A	I	R	T	F	L	Q	Q	N	A	N	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																					?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	G	D	C	L	T	I	P	D	S	S	A	T	Q	R	V	S	A	S	P	A	T	T	G	A	R	T	M	T	A	W	T	Q	D	L	I	Y	A	G	D	P	V	H	Y	H	G	S	R	A	T	E	G	T	L	S	W	R	Q	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?	?	?	?	?	?	?										?										?					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	Q	A	G	Q	G	E	R	Y	D	Q	I	L	A	F	A	Y	P	D	N	S	L	S	R	W	G	A	P	R	S	T	C	Q	L	L	P	K	A	K	A	W	L	A	K	K	M	P	Q	W	R	R	I	L	Q	A	E	T	G	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?					?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	P	D	V	F	A	V	C	R	L	V	S	G	F	P	Y	T	D	R	Q	Q	K	R	L	F	I	R	N	F	F	T	L	Q	D	R	L	D	L	T	H	E	Y	L	H	L	A	F	D	G	Y	P	T	G	L	D	E	N	Y	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	L	T	R	Q	L	L	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand