Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77416 Date Thu Jan 5 12:29:02 GMT 2012 Unique Job ID 65e9888d47d12a86

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	N	L	A	L	T	T	L	L	L	P	F	I	G	A	L	V	V	S	F	S	P	Q	R	R	A	A	E	W	G	V	L	F	A	A	L	T	T	L	C	M	L	S	L	I	S	A	F	Y	Q	A	D	K	V	A	V	T	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																						?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	V	N	V	G	D	V	A	L	F	G	L	V	I	D	R	V	S	T	L	I	L	F	V	V	V	F	L	G	L	L	V	T	I	Y	S	T	G	Y	L	T	D	K	N	R	E	H	P	H	N	G	T	N	R	Y	Y	A	F	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?	?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	F	I	G	A	M	A	G	L	V	L	S	S	T	L	L	G	Q	L	L	F	F	E	I	T	G	G	C	S	W	A	L	I	S	Y	Y	Q	S	D	K	A	Q	R	S	A	L	K	A	L	L	I	T	H	I	G	S	L	G	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	A	A	A	T	L	F	L	Q	T	G	T	F	A	L	S	A	M	S	E	L	H	G	D	A	R	Y	L	V	Y	G	G	I	L	F	A	A	W	G	K	S	A	Q	L	P	M	Q	A	W	L	P	D	A	M	E	A	P	T	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	A	Y	L	H	A	A	S	M	V	K	V	G	V	Y	I	F	A	R	A	I	I	D	G	G	N	I	P	H	V	I	G	G	V	G	M	V	M	A	L	V	T	I	L	Y	G	F	L	M	Y	L	P	Q	Q	D	M	K	R	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	W	S	T	I	T	Q	L	G	W	M	F	F	G	L	S	L	S	I	F	G	S	R	L	A	L	E	G	S	I	A	Y	I	V	N	H	A	F	A	K	S	L	F	F	L	V	A	G	A	L	S	Y	S	C	G	T	R	L	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	L	R	G	V	L	H	T	L	P	L	P	G	V	G	F	C	V	A	A	L	A	I	T	G	V	P	P	F	N	G	F	F	S	K	F	P	L	F	A	A	G	F	A	L	S	V	E	Y	W	I	L	L	P	A	M	I	L	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	E	S	V	A	S	F	A	W	F	I	R	W	F	G	R	V	V	P	G	K	P	S	E	A	V	A	D	A	A	P	L	P	G	S	M	R	L	V	L	I	V	L	I	V	M	S	L	I	S	S	V	I	A	A	T	W	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand