Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08722 Date Thu Jan 5 11:01:37 GMT 2012 Unique Job ID 6526919da970ee01

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	E	L	A	R	K	I	V	A	G	V	G	G	A	D	N	I	V	S	L	M	H	C	A	T	R	L	R	F	K	L	K	D	E	S	K	A	Q	A	E	V	L	K	K	T	P	G	I	I	M	V	V	E	S	G	G	Q	F	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	V	I	G	N	H	V	A	D	V	F	L	A	V	N	S	V	A	G	L	D	E	K	A	Q	Q	A	P	E	N	D	D	K	G	N	L	L	N	R	F	V	Y	V	I	S	G	I	F	T	P	L	I	G	L	M	A	A	T	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	K	G	M	L	A	L	A	L	T	F	Q	W	T	T	E	Q	S	G	T	Y	L	I	L	F	S	A	S	D	A	L	F	W	F	F	P	I	I	L	G	Y	T	A	G	K	R	F	G	G	N	P	F	T	A	M	V	I	G	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	V	H	P	L	I	L	T	A	F	E	N	G	Q	K	A	D	A	L	G	L	D	F	L	G	I	P	V	T	L	L	N	Y	S	S	S	V	I	P	I	I	F	S	A	W	L	C	S	I	L	E	R	R	L	N	A	W	L	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	I	K	N	F	F	T	P	L	L	C	L	M	V	I	T	P	V	T	F	L	L	V	G	P	L	S	T	W	I	S	E	L	I	A	A	G	Y	L	W	L	Y	Q	A	V	P	A	F	A	G	A	V	M	G	G	F	W	Q	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	M	F	G	L	H	W	G	L	V	P	L	C	I	N	N	F	T	V	L	G	Y	D	T	M	I	P	L	L	M	P	A	I	M	A	Q	V	G	A	A	L	G	V	F	L	C	E	R	D	A	Q	K	K	V	V	A	G	S	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?																							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	T	S	L	F	G	I	T	E	P	A	V	Y	G	V	N	L	P	R	K	Y	P	F	V	I	A	C	I	S	G	A	L	G	A	T	I	I	G	Y	A	Q	T	K	V	Y	S	F	G	L	P	S	I	F	T	F	M	Q	T	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?		?		?		?							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	T	G	I	D	F	T	V	W	A	S	V	I	G	G	V	I	A	I	G	C	A	F	V	G	T	V	M	L	H	F	I	T	A	K	R	Q	P	A	Q	G	A	P	Q	E	K	T	P	E	V	I	T	P	P	E	Q	G	G	I	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	P	M	T	G	E	I	V	P	L	I	H	V	A	D	T	T	F	A	S	G	L	L	G	K	G	I	A	I	L	P	S	V	G	E	V	R	S	P	V	A	G	R	I	A	S	L	F	A	T	L	H	A	I	G	I	E	S	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		G	V	E	I	L	I	H	V	G	I	D	T	V	K	L	D	G	K	F	F	S	A	H	V	N	V	G	D	K	V	N	T	G	D	R	L	I	S	F	D	I	P	A	I	R	E	A	G	F	D	L	T	T	P	V	L	I	S	N	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.
Sequence		D	D	F	T	D	V	L	P	H	G	T	A	Q	I	S	A	G	E	P	L	L	S	I	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?	?	?	?	?	?	?										?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand