Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P09127 Date Thu Jan 5 11:01:53 GMT 2012 Unique Job ID 64327bbc81dc4f3e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	E	Q	E	K	T	S	A	V	V	E	E	T	R	E	A	V	D	T	T	S	Q	P	V	A	T	E	K	K	S	K	N	N	T	A	L	I	L	S	A	V	A	I	A	I	A	L	A	A	G	I	G	L	Y	G	W	G	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	A	V	N	Q	T	A	T	S	D	A	L	A	N	Q	L	T	A	L	Q	K	A	Q	E	S	Q	K	A	E	L	E	G	I	I	K	Q	Q	A	A	Q	L	K	Q	A	N	R	Q	Q	E	T	L	A	K	Q	L	D	E	V	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	V	A	T	I	S	G	S	D	A	K	T	W	L	L	A	Q	A	D	F	L	V	K	L	A	G	R	K	L	W	S	D	Q	D	V	T	T	A	A	A	L	L	K	S	A	D	A	S	L	A	D	M	N	D	P	S	L	I	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?																																											?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	R	A	I	T	D	D	I	A	S	L	S	A	V	S	Q	V	D	Y	D	G	I	I	L	K	L	N	Q	L	S	N	Q	V	D	N	L	R	L	A	D	N	D	S	D	G	S	P	M	D	S	D	G	E	E	L	S	S	S	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?																?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	W	R	I	N	L	Q	K	S	W	Q	N	F	M	D	N	F	I	T	I	R	R	R	D	D	T	A	V	P	L	L	A	P	N	Q	D	I	Y	L	R	E	N	I	R	S	R	L	L	V	A	A	Q	A	V	P	R	H	Q	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	Y	R	Q	A	L	E	N	V	S	T	W	V	R	A	Y	Y	D	T	D	D	A	T	T	K	A	F	L	D	E	V	D	Q	L	S	Q	Q	N	I	S	M	D	L	P	E	T	L	Q	S	Q	A	M	L	E	K	L	M	Q	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Sequence		V	R	N	L	L	A	Q	P	A	A	G	T	T	E	A	K	P	A	P	A	P	Q	A	D	T	P	A	A	A	P	Q	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand