Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76128 Date Thu Jan 5 12:19:19 GMT 2012 Unique Job ID 63ca54b846e75063

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	S	I	S	F	R	P	T	L	L	A	L	V	L	A	T	N	F	P	V	A	H	A	A	V	P	K	D	M	L	V	I	G	K	A	A	D	P	Q	T	L	D	P	A	V	T	I	D	N	N	D	W	T	V	T	Y	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	Q	R	L	V	Q	Y	K	T	D	G	D	K	G	S	T	D	V	E	G	D	L	A	S	S	W	K	A	S	D	D	Q	K	E	W	T	F	T	L	K	D	N	A	K	F	A	D	G	T	P	V	T	A	E	A	V	K	L	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	R	L	L	K	I	G	Q	G	P	A	E	A	F	P	K	D	L	K	I	D	A	P	D	E	H	T	V	K	F	T	L	S	Q	P	F	A	P	F	L	Y	T	L	A	N	D	G	A	S	I	I	N	P	A	V	L	K	E	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	D	D	A	R	G	F	L	A	Q	N	T	A	G	S	G	P	F	M	L	K	S	W	Q	K	G	Q	Q	L	V	L	V	P	N	P	H	Y	P	G	N	K	P	N	F	K	R	V	S	V	K	I	I	G	E	S	A	S	R	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	L	S	R	G	D	I	D	I	A	D	A	L	P	V	D	Q	L	N	A	L	K	Q	E	N	K	V	N	V	A	E	Y	P	S	L	R	V	T	Y	L	Y	L	N	N	S	K	A	P	L	N	Q	A	D	L	R	R	A	I	S	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	T	D	Y	Q	G	M	V	N	G	I	L	S	G	N	G	K	Q	M	R	G	P	I	P	E	G	M	W	G	Y	D	A	T	A	M	Q	Y	N	H	D	E	T	K	A	K	A	E	W	D	K	V	T	S	K	P	T	S	L	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	Y	S	D	N	D	P	N	W	E	P	I	A	L	A	T	Q	S	S	L	N	K	L	G	I	I	V	K	L	E	K	L	A	N	A	T	M	R	D	R	V	G	K	G	D	Y	D	I	A	I	G	N	W	S	P	D	F	A	D	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	M	F	M	N	Y	W	F	E	S	D	K	K	G	L	P	G	N	R	S	F	Y	E	N	S	E	V	D	K	L	L	R	N	A	L	A	T	T	D	Q	T	Q	R	T	R	D	Y	Q	Q	A	Q	K	I	V	I	D	D	A	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	Y	L	F	Q	K	N	Y	Q	L	A	M	N	K	E	V	K	G	F	V	F	N	P	M	L	E	Q	V	F	N	I	N	T	M	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?		?	?		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand