Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32128 Date Thu Jan 5 11:49:13 GMT 2012 Unique Job ID 633b228f22d4fabd

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	R	K	S	A	T	G	V	I	V	A	L	A	V	I	W	G	G	G	T	W	Y	T	G	T	Q	I	Q	P	G	V	E	K	F	I	K	D	F	N	D	A	K	K	K	G	E	H	A	Y	D	M	T	L	S	Y	Q	N	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	G	F	F	N	S	R	F	Q	M	Q	M	T	F	D	N	G	A	P	D	L	N	I	K	P	G	Q	K	V	V	F	D	V	D	V	E	H	G	P	L	P	I	T	M	L	M	H	G	N	V	I	P	A	L	A	A	A	K	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	V	N	N	E	L	T	Q	P	L	F	I	A	A	K	N	K	S	P	V	E	A	T	L	R	F	A	F	G	G	S	F	S	T	T	L	D	V	A	P	A	E	Y	G	K	F	S	F	G	E	G	Q	F	T	F	N	G	D	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?		?	?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	L	S	N	L	D	I	E	G	K	V	E	D	I	V	L	Q	L	S	P	M	N	K	V	T	A	K	S	F	T	I	D	S	L	A	R	L	E	E	K	K	F	P	V	G	E	S	E	S	K	F	N	Q	I	N	I	I	N	H	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?									?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	D	V	A	Q	I	D	A	F	V	A	K	T	R	L	D	R	V	K	D	K	D	Y	I	N	V	N	L	T	Y	E	L	D	K	L	T	K	G	N	Q	Q	L	G	S	G	E	W	S	L	I	A	E	S	I	D	P	S	A	V	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	F	I	I	Q	Y	N	I	A	M	Q	K	Q	L	A	A	H	P	E	L	A	N	D	E	V	A	L	Q	E	V	N	A	A	L	F	K	E	Y	L	P	L	L	Q	K	S	E	P	T	I	K	Q	P	V	R	W	K	N	A	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	L	N	A	N	L	D	I	S	I	A	D	P	A	K	S	S	S	S	T	N	K	D	I	K	S	L	N	F	D	V	K	L	P	L	N	V	V	T	E	T	A	K	Q	L	N	L	S	E	G	M	D	A	E	K	A	Q	K	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?												?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?		?	?	?															?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Sequence		D	K	Q	I	S	G	M	M	T	L	G	Q	M	F	Q	L	I	T	I	D	N	N	T	A	S	L	Q	L	R	Y	T	P	G	K	V	V	F	N	G	Q	E	M	S	E	E	E	F	M	S	R	A	G	R	F	V	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?																			?																					?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand