Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P15723 Date Thu Jan 5 11:34:52 GMT 2012 Unique Job ID 62d052af71b1f253

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Q	I	D	F	R	K	K	I	N	W	H	R	R	Y	R	S	P	Q	G	V	K	T	E	H	E	I	L	R	I	F	E	S	D	R	G	R	I	I	N	S	P	A	I	R	R	L	Q	Q	K	T	Q	V	F	P	L	E	R	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	A	V	R	T	R	L	T	H	S	M	E	V	Q	Q	V	G	R	Y	I	A	K	E	I	L	S	R	L	K	E	L	K	L	L	E	A	Y	G	L	D	E	L	T	G	P	F	E	S	I	V	E	M	S	C	L	M	H	D	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	P	P	F	G	H	F	G	E	A	A	I	N	D	W	F	R	Q	R	L	H	P	E	D	A	E	S	Q	P	L	T	D	D	R	C	S	V	A	A	L	R	L	R	D	G	E	E	P	L	N	E	L	R	R	K	I	R	Q	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	H	F	E	G	N	A	Q	G	I	R	L	V	H	T	L	M	R	M	N	L	T	W	A	Q	V	G	G	I	L	K	Y	T	R	P	A	W	W	R	G	E	T	P	E	T	H	H	Y	L	M	K	K	P	G	Y	Y	L	S	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	Y	I	A	R	L	R	K	E	L	N	L	A	L	Y	S	R	F	P	L	T	W	I	M	E	A	A	D	D	I	S	Y	C	V	A	D	L	E	D	A	V	E	K	R	I	F	T	V	E	Q	L	Y	H	H	L	H	E	A	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	H	E	K	G	S	L	F	S	L	V	V	E	N	A	W	E	K	S	R	S	N	S	L	S	R	S	T	E	D	Q	F	F	M	Y	L	R	V	N	T	L	N	K	L	V	P	Y	A	A	Q	R	F	I	D	N	L	P	A	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	G	T	F	N	H	A	L	L	E	D	A	S	E	C	S	D	L	L	K	L	Y	K	N	V	A	V	K	H	V	F	S	H	P	D	V	E	R	L	E	L	Q	G	Y	R	V	I	S	G	L	L	E	I	Y	R	P	L	L	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	L	S	D	F	T	E	L	V	E	K	E	R	V	K	R	F	P	I	E	S	R	L	F	H	K	L	S	T	R	H	R	L	A	Y	V	E	A	V	S	K	L	P	S	D	S	P	E	F	P	L	W	E	Y	Y	Y	R	C	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?									?	?																								?	?	?	?			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Sequence		L	Q	D	Y	I	S	G	M	T	D	L	Y	A	W	D	E	Y	R	R	L	M	A	V	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand