Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08957 Date Thu Jan 5 11:01:44 GMT 2012 Unique Job ID 62950df1d9ecae1f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	N	N	D	L	V	A	K	L	W	K	L	C	D	N	L	R	D	G	G	V	S	Y	Q	N	Y	V	N	E	L	A	S	L	L	F	L	K	M	C	K	E	T	G	Q	E	A	E	Y	L	P	E	G	Y	R	W	D	D	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																											?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	R	I	G	Q	E	Q	L	Q	F	Y	R	K	M	L	V	H	L	G	E	D	D	K	K	L	V	Q	A	V	F	H	N	V	S	T	T	I	T	E	P	K	Q	I	T	A	L	V	S	N	M	D	S	L	D	W	Y	N	G	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																																		?																	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	K	S	R	D	D	F	G	D	M	Y	E	G	L	L	Q	K	N	A	N	E	T	K	S	G	A	G	Q	Y	F	T	P	R	P	L	I	K	T	I	I	H	L	L	K	P	Q	P	R	E	V	V	Q	D	P	A	A	G	T	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	L	I	E	A	D	R	Y	V	K	S	Q	T	N	D	L	D	D	L	D	G	D	T	Q	D	F	Q	I	H	R	A	F	I	G	L	E	L	V	P	G	T	R	R	L	A	L	M	N	C	L	L	H	D	I	E	G	N	L	D	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	G	A	I	R	L	G	N	T	L	G	S	D	G	E	N	L	P	K	A	H	I	V	A	T	N	P	P	F	G	S	A	A	G	T	N	I	T	R	T	F	V	H	P	T	S	N	K	Q	L	C	F	M	Q	H	I	I	E	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		H	P	G	G	R	A	A	V	V	V	P	D	N	V	L	F	E	G	G	K	G	T	D	I	R	R	D	L	M	D	K	C	H	L	H	T	I	L	R	L	P	T	G	I	F	Y	A	Q	G	V	K	T	N	V	L	F	F	T	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	V	A	N	P	N	Q	D	K	N	C	T	D	D	V	W	V	Y	D	L	R	T	N	M	P	S	F	G	K	R	T	P	F	T	D	E	H	L	Q	P	F	E	R	V	Y	G	E	D	P	H	G	L	S	P	R	T	E	G	E	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?										?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?																	?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
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Sequence		S	F	N	A	E	E	T	E	V	A	D	S	E	E	N	K	N	T	D	Q	H	L	A	T	S	R	W	R	K	F	S	R	E	W	I	R	T	A	K	S	D	S	L	D	I	S	W	L	K	D	K	D	S	I	D	A	D	S	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?		?												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		E	P	D	V	L	A	A	E	A	M	G	E	L	V	Q	A	L	S	E	L	D	A	L	M	R	E	L	G	A	S	D	E	A	D	L	Q	R	Q	L	L	E	E	A	F	G	G	V	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																												?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand