Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P03819 Date Thu Jan 5 10:58:01 GMT 2012 Unique Job ID 62190687ea7e3136

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	S	H	T	L	I	Q	A	L	I	Y	L	G	S	A	A	L	I	V	P	I	A	V	R	L	G	L	G	S	V	L	G	Y	L	I	A	G	C	I	I	G	P	W	G	L	R	L	V	T	D	A	E	S	I	L	H	F	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	G	V	V	L	M	L	F	I	I	G	L	E	L	D	P	Q	R	L	W	K	L	R	A	A	V	F	G	C	G	A	L	Q	M	V	I	C	G	G	L	L	G	L	F	C	M	L	L	G	L	R	W	Q	V	A	E	L	I	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	A	L	S	S	T	A	I	A	M	Q	A	M	N	E	R	N	L	M	V	T	Q	M	G	R	S	A	F	A	V	L	L	F	Q	D	I	A	A	I	P	L	V	A	M	I	P	L	L	A	T	S	S	A	S	T	T	M	G	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	A	L	S	A	L	K	V	A	G	A	L	V	L	V	V	L	L	G	R	Y	V	T	R	P	A	L	R	F	V	A	R	S	G	L	R	E	V	F	S	A	V	A	L	F	L	V	F	G	F	G	L	L	L	E	E	V	G	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	A	M	G	A	F	L	A	G	V	L	L	A	S	S	E	Y	R	H	A	L	E	S	D	I	E	P	F	K	G	L	L	L	G	L	F	F	I	G	V	G	M	S	I	D	F	G	T	L	L	E	N	P	L	R	I	V	I	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	G	F	L	I	I	K	I	A	M	L	W	L	I	A	R	P	L	Q	V	P	N	K	Q	R	R	W	F	A	V	L	L	G	Q	G	S	E	F	A	F	V	V	F	G	A	A	Q	M	A	N	V	L	E	P	E	W	A	K	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	L	A	V	A	L	S	M	A	A	T	P	I	L	L	V	I	L	N	R	L	E	Q	S	S	T	E	E	A	R	E	A	D	E	I	D	E	E	Q	P	R	V	I	I	A	G	F	G	R	F	G	Q	I	T	G	R	L	L	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	G	V	K	M	V	V	L	D	H	D	P	D	H	I	E	T	L	R	K	F	G	M	K	V	F	Y	G	D	A	T	R	M	D	L	L	E	S	A	G	A	A	K	A	E	V	L	I	N	A	I	D	D	P	Q	T	N	L	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	E	M	V	K	E	H	F	P	H	L	Q	I	I	A	R	A	R	D	V	D	H	Y	I	R	L	R	Q	A	G	V	E	K	P	E	R	E	T	F	E	G	A	L	K	T	G	R	L	A	L	E	S	L	G	L	G	P	Y	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	E	R	A	D	V	F	R	R	F	N	I	Q	M	V	E	E	M	A	M	V	E	N	D	T	K	A	R	A	A	V	Y	K	R	T	S	A	M	L	S	E	I	I	T	E	D	R	E	H	L	S	L	I	Q	R	H	G	W	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?							?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620
Sequence		T	E	E	G	K	H	T	G	N	M	A	D	E	P	E	T	K	P	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand