Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFY6 Date Thu Jan 5 11:27:34 GMT 2012 Unique Job ID 6194613e34bc1bf0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	K	S	F	F	P	K	P	G	T	F	F	L	S	A	F	V	W	A	L	I	A	V	I	F	W	Q	A	G	G	G	D	W	V	A	R	I	T	G	A	S	G	Q	I	P	I	S	A	A	R	F	W	S	L	D	F	L	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	A	Y	Y	I	V	C	V	G	L	F	A	L	F	W	F	I	Y	S	P	H	R	W	Q	Y	W	S	I	L	G	T	A	L	I	I	F	V	T	W	F	L	V	E	V	G	V	A	V	N	A	W	Y	A	P	F	Y	D	L	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	A	L	S	S	P	H	K	V	T	I	E	Q	F	Y	R	E	V	G	V	F	L	G	I	A	L	I	A	V	V	I	S	V	L	N	N	F	F	V	S	H	Y	V	F	R	W	R	T	A	M	N	E	Y	Y	M	A	N	W	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	R	H	I	E	G	A	A	Q	R	V	Q	E	D	T	M	R	F	A	S	T	L	E	N	M	G	V	S	F	I	N	A	I	M	T	L	I	A	F	L	P	V	L	V	T	L	S	A	H	V	P	E	L	P	I	I	G	H	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	G	L	V	I	A	A	I	V	W	S	L	M	G	T	G	L	L	A	V	V	G	I	K	L	P	G	L	E	F	K	N	Q	R	V	E	A	A	Y	R	K	E	L	V	Y	G	E	D	D	A	T	R	A	T	P	P	T	V	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?					?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	F	S	A	V	R	K	N	Y	F	R	L	Y	F	H	Y	M	Y	F	N	I	A	R	I	L	Y	L	Q	V	D	N	V	F	G	L	F	L	L	F	P	S	I	V	A	G	T	I	T	L	G	L	M	T	Q	I	T	N	V	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	V	R	G	A	F	Q	Y	L	I	N	S	W	T	T	L	V	E	L	M	S	I	Y	K	R	L	R	S	F	E	H	E	L	D	G	D	K	I	Q	E	V	T	H	T	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand