Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFE8 Date Thu Jan 5 11:26:03 GMT 2012 Unique Job ID 617700bab3646338

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	L	P	W	L	I	L	I	P	F	I	G	G	F	L	C	W	Q	T	E	R	F	G	V	K	V	P	R	W	I	A	L	I	T	M	G	L	T	L	A	L	S	L	Q	L	W	L	Q	G	G	Y	S	L	T	Q	S	A	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																				?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	Q	W	Q	S	E	F	D	M	P	W	I	P	R	F	G	I	S	I	H	L	A	I	D	G	L	S	L	L	M	V	V	L	T	G	L	L	G	V	L	A	V	L	C	S	W	K	E	I	E	K	Y	Q	G	F	F	H	L	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		M	W	I	L	G	G	V	I	G	V	F	L	A	I	D	M	F	L	F	F	F	F	W	E	M	M	L	V	P	M	Y	F	L	I	A	L	W	G	H	K	A	S	D	G	K	T	R	I	T	A	A	T	K	F	F	I	Y	T	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	G	L	V	M	L	I	A	I	L	A	L	V	F	V	H	Y	N	A	T	G	V	W	T	F	N	Y	E	E	L	L	N	T	P	M	S	S	G	V	E	Y	L	L	M	L	G	F	F	I	A	F	A	V	K	M	P	V	V	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?		?	?	?	?									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		H	G	W	L	P	D	A	H	S	Q	A	P	T	A	G	S	V	D	L	A	G	I	L	L	K	T	A	A	Y	G	L	L	R	F	S	L	P	L	F	P	N	A	S	A	E	F	A	P	I	A	M	W	L	G	V	I	G	I	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	W	M	A	F	A	Q	T	D	I	K	R	L	I	A	Y	T	S	V	S	H	M	G	F	V	L	I	A	I	Y	T	G	S	Q	L	A	Y	Q	G	A	V	I	Q	M	I	A	H	G	L	S	A	A	G	L	F	I	L	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	L	Y	E	R	I	H	T	R	D	M	R	M	M	G	G	L	W	S	K	M	K	W	L	P	A	L	S	L	F	F	A	V	A	T	L	G	M	P	G	T	G	N	F	V	G	E	F	M	I	L	F	G	S	F	Q	V	V	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?																					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	T	V	I	S	T	F	G	L	V	F	A	S	V	Y	S	L	A	M	L	H	R	A	Y	F	G	K	A	K	S	Q	I	A	S	Q	E	L	P	G	M	S	L	R	E	L	F	M	I	L	L	L	V	V	L	L	V	L	L	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?			?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	P	Q	P	I	L	D	T	S	H	S	A	I	G	N	I	Q	Q	W	F	V	N	S	V	T	T	T	R	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand