Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77747 Date Thu Jan 5 12:32:27 GMT 2012 Unique Job ID 615886ea299022e3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	S	K	V	L	A	L	L	I	P	A	L	L	A	A	G	A	A	H	A	A	E	V	Y	N	K	D	G	N	K	L	D	L	Y	G	K	V	D	G	L	H	Y	F	S	D	N	S	A	K	D	G	D	Q	S	Y	A	R	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?												?		?	?					?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	K	G	E	T	Q	I	N	D	Q	L	T	G	Y	G	Q	W	E	Y	N	I	Q	A	N	N	T	E	S	S	K	N	Q	S	W	T	R	L	A	F	A	G	L	K	F	A	D	Y	G	S	F	D	Y	G	R	N	Y	G	V	M	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	I	E	G	W	T	D	M	L	P	E	F	G	G	D	S	Y	T	N	A	D	N	F	M	T	G	R	A	N	G	V	A	T	Y	R	N	T	D	F	F	G	L	V	N	G	L	N	F	A	V	Q	Y	Q	G	N	N	E	G	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?			?																?	?	?												?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	G	Q	E	G	T	N	N	G	R	D	V	R	H	E	N	G	D	G	W	G	L	S	T	T	Y	D	L	G	M	G	F	S	A	G	A	A	Y	T	S	S	D	R	T	N	D	Q	V	N	H	T	A	A	G	G	D	K	A	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?		?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	T	A	G	L	K	Y	D	A	N	N	I	Y	L	A	T	M	Y	S	E	T	R	N	M	T	P	F	G	D	S	D	Y	A	V	A	N	K	T	Q	N	F	E	V	T	A	Q	Y	Q	F	D	F	G	L	R	P	A	V	S	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?	?		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	S	K	G	R	D	L	H	A	A	G	G	A	D	N	P	A	G	V	D	D	K	D	L	V	K	Y	A	D	I	G	A	T	Y	Y	F	N	K	N	M	S	T	Y	V	D	Y	K	I	N	L	L	D	E	D	D	S	F	Y	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?									?	?	?		?																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		N	G	I	S	T	D	D	I	V	A	L	G	L	V	Y	Q	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?												?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand