Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P25714 Date Thu Jan 5 11:42:16 GMT 2012 Unique Job ID 6153acb633a4f4cf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	S	Q	R	N	L	L	V	I	A	L	L	F	V	S	F	M	I	W	Q	A	W	E	Q	D	K	N	P	Q	P	Q	A	Q	Q	T	T	Q	T	T	T	T	A	A	G	S	A	A	D	Q	G	V	P	A	S	G	Q	G	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																					?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	S	V	K	T	D	V	L	D	L	T	I	N	T	R	G	G	D	V	E	Q	A	L	L	P	A	Y	P	K	E	L	N	S	T	Q	P	F	Q	L	L	E	T	S	P	Q	F	I	Y	Q	A	Q	S	G	L	T	G	R	D	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?		?									?	?	?	?	?							?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	N	P	A	N	G	P	R	P	L	Y	N	V	E	K	D	A	Y	V	L	A	E	G	Q	N	E	L	Q	V	P	M	T	Y	T	D	A	A	G	N	T	F	T	K	T	F	V	L	K	R	G	D	Y	A	V	N	V	N	Y	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?		?		?	?		?					?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	N	A	G	E	K	P	L	E	I	S	S	F	G	Q	L	K	Q	S	I	T	L	P	P	H	L	D	T	G	S	S	N	F	A	L	H	T	F	R	G	A	A	Y	S	T	P	D	E	K	Y	E	K	Y	K	F	D	T	I	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	E	N	L	N	I	S	S	K	G	G	W	V	A	M	L	Q	Q	Y	F	A	T	A	W	I	P	H	N	D	G	T	N	N	F	Y	T	A	N	L	G	N	G	I	A	A	I	G	Y	K	S	Q	P	V	L	V	Q	P	G	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?	?				?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	M	N	S	T	L	W	V	G	P	E	I	Q	D	K	M	A	A	V	A	P	H	L	D	L	T	V	D	Y	G	W	L	W	F	I	S	Q	P	L	F	K	L	L	K	W	I	H	S	F	V	G	N	W	G	F	S	I	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																		?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	T	F	I	V	R	G	I	M	Y	P	L	T	K	A	Q	Y	T	S	M	A	K	M	R	M	L	Q	P	K	I	Q	A	M	R	E	R	L	G	D	D	K	Q	R	I	S	Q	E	M	M	A	L	Y	K	A	E	K	V	N	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	G	C	F	P	L	L	I	Q	M	P	I	F	L	A	L	Y	Y	M	L	M	G	S	V	E	L	R	Q	A	P	F	A	L	W	I	H	D	L	S	A	Q	D	P	Y	Y	I	L	P	I	L	M	G	V	T	M	F	F	I	Q	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	S	P	T	T	V	T	D	P	M	Q	Q	K	I	M	T	F	M	P	V	I	F	T	V	F	F	L	W	F	P	S	G	L	V	L	Y	Y	I	V	S	N	L	V	T	I	I	Q	Q	Q	L	I	Y	R	G	L	E	K	R	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		H	S	R	E	K	K	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand