Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76361 Date Thu Jan 5 12:22:20 GMT 2012 Unique Job ID 6065ac5873f4750b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	Q	I	V	G	A	L	I	L	L	I	A	G	F	A	I	L	R	L	L	F	R	A	L	I	S	T	A	S	A	L	A	G	L	I	L	L	C	L	F	G	P	A	L	L	A	G	Y	I	T	E	R	I	T	R	L	F	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	W	L	A	G	V	F	L	T	I	A	G	M	I	I	S	F	M	W	G	L	D	G	K	H	I	A	L	E	A	H	T	F	D	S	V	K	F	I	L	T	T	A	L	A	G	G	L	L	A	V	P	L	Q	I	K	N	I	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																														?										?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	G	I	T	P	E	D	I	S	K	E	I	N	G	Y	Y	C	C	F	Y	T	A	F	F	L	M	A	C	S	A	C	A	P	L	I	A	L	Q	Y	D	I	S	P	S	L	M	W	W	G	G	L	L	Y	W	L	A	A	L	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	L	W	A	A	S	Q	I	Q	A	L	K	K	L	T	C	A	I	S	Q	T	L	E	E	Q	P	V	L	N	S	K	S	W	L	T	S	L	Q	N	D	Y	S	L	P	D	S	L	T	E	R	I	W	L	T	L	I	S	Q	R	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?						?	?																													?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	R	G	E	L	R	E	F	E	L	A	D	G	N	W	L	L	N	N	A	W	Y	E	R	N	M	A	G	F	N	E	Q	L	K	E	N	L	S	F	T	P	D	E	L	K	T	L	F	R	N	R	L	N	L	S	P	E	A	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	F	L	D	R	C	L	D	G	G	D	W	Y	P	F	S	E	G	R	R	F	V	S	F	H	H	V	D	E	L	R	I	C	A	S	C	G	L	T	E	V	H	H	A	P	E	N	H	K	P	D	P	E	W	Y	C	S	S	L	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?				?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	E	T	E	T	L	C	Q	E	I	Y	E	R	P	Y	N	S	F	I	S	D	A	T	A	N	G	L	I	L	M	K	L	P	E	T	W	S	T	N	E	K	M	F	A	S	G	G	Q	G	H	G	F	A	A	E	R	G	N	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?			?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	D	R	V	R	L	K	N	A	R	I	L	G	D	N	N	A	R	N	G	A	D	R	L	V	S	G	T	E	I	Q	T	K	Y	C	S	T	A	A	R	S	V	G	A	A	F	D	G	Q	N	G	Q	Y	R	Y	M	G	N	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?			?	?		?	?			?																				?						?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Sequence		P	M	Q	L	E	V	P	R	D	Q	Y	A	G	A	V	E	T	M	R	N	K	I	R	E	G	K	V	E	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																							?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand