Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39401 Date Thu Jan 5 12:00:36 GMT 2012 Unique Job ID 5feb9c95edd1fc64

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	E	L	L	S	F	A	L	F	L	A	S	V	L	I	Y	A	W	K	A	G	R	N	T	W	W	F	A	A	T	L	T	V	L	G	L	F	V	V	L	N	I	T	L	F	A	S	D	Y	F	T	G	D	G	I	N	D	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	Y	T	L	T	N	S	L	T	G	A	G	V	S	K	Y	I	L	P	G	I	G	I	V	L	G	L	T	A	V	F	G	A	L	G	W	I	L	R	R	R	R	H	H	P	H	H	F	G	Y	S	L	L	A	L	L	L	A	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?																										?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	V	D	A	S	P	A	F	R	Q	I	T	E	L	V	K	S	Q	S	R	D	G	D	P	D	F	A	A	Y	Y	K	E	P	S	K	T	I	P	D	P	K	L	N	L	V	Y	I	Y	G	E	S	L	E	R	T	Y	F	D	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?																					?	?
Disorder confidence
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Sequence		A	F	P	D	L	T	P	E	L	G	A	L	K	N	E	G	L	D	F	S	H	T	Q	Q	L	P	G	T	D	Y	T	I	A	G	M	V	A	S	Q	C	G	I	P	L	F	A	P	F	E	G	N	A	S	A	S	V	S	S	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?			?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		P	Q	N	I	C	L	G	D	I	L	K	N	S	G	Y	Q	N	Y	F	V	Q	G	A	N	L	R	F	A	G	K	D	V	F	L	K	S	H	G	F	D	H	L	Y	G	S	E	E	L	K	S	V	V	A	D	P	H	Y	R	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																							?		?	?	?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	G	F	Y	D	D	T	V	L	D	E	A	W	K	K	F	E	E	L	S	R	S	G	Q	R	F	S	L	F	T	L	T	V	D	T	H	H	P	D	G	F	I	S	R	T	C	N	R	K	K	Y	D	F	D	G	K	P	N	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	S	A	V	S	C	S	Q	E	N	I	A	T	F	I	N	K	I	K	A	S	P	W	F	K	D	T	V	I	V	V	S	S	D	H	L	A	M	N	N	T	A	W	K	Y	L	N	K	Q	D	R	N	N	L	F	F	V	I	R	G
Secondary structure
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Disorder																																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	K	P	Q	Q	E	T	L	A	V	K	R	N	T	M	D	N	G	A	T	V	L	D	I	L	G	G	D	N	Y	L	G	L	G	R	S	S	L	S	G	Q	S	M	S	E	I	F	L	N	I	K	E	K	T	L	A	W	K	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?																																																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	I	R	L	W	K	F	P	K	E	M	K	E	F	T	I	D	Q	Q	K	N	M	I	A	F	S	G	S	H	F	R	L	P	L	L	L	R	V	S	D	K	R	V	E	P	L	P	E	S	E	Y	S	A	P	L	R	F	Q	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?							?	?	?													?					?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		D	F	A	P	R	D	N	F	V	W	V	D	R	C	Y	K	M	A	Q	L	W	A	P	E	L	A	L	S	T	D	W	C	V	S	Q	G	Q	L	G	G	Q	Q	I	V	Q	H	V	D	K	T	T	W	Q	G	K	T	A	F	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?									?											?	?						?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		T	V	I	D	M	A	R	Y	K	G	N	V	D	T	L	K	I	V	D	N	D	I	R	Y	K	A	D	S	F	I	F	N	V	A	G	A	P	E	E	V	K	Q	F	S	G	I	S	R	P	E	S	W	G	R	W	S	N	A	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?							?	?					?	?	?	?	?	?			?																					?	?		?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	D	E	V	K	I	E	Y	K	H	P	L	P	K	K	F	D	L	V	I	T	A	K	A	Y	G	N	N	A	S	R	P	I	P	V	R	V	G	N	E	E	Q	T	L	V	L	G	N	E	V	T	T	T	T	L	H	F	D	N	P
Secondary structure
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.
Sequence		T	D	A	D	T	L	V	I	V	P	P	E	P	V	S	T	N	E	G	N	I	L	G	H	S	P	R	K	L	G	I	G	M	V	E	I	K	V	V	E	R	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand