Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77562 Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Unique Job ID 5ed76fbabc693a5e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	R	V	N	P	L	S	S	L	S	L	L	A	V	L	V	L	A	G	C	S	S	Q	A	P	Q	P	L	K	K	G	E	K	A	I	D	V	A	S	V	V	R	Q	K	M	P	A	S	V	K	D	R	D	A	W	A	K	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?										?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	T	T	F	E	S	Q	G	L	A	P	T	L	E	N	V	C	S	V	L	A	V	A	Q	Q	E	S	N	Y	Q	A	D	P	A	V	P	G	L	S	K	I	A	W	Q	E	I	D	R	R	A	E	R	M	H	I	P	A	F	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?		?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		H	T	A	L	K	I	K	S	P	N	G	K	S	Y	S	E	R	L	D	S	V	R	T	E	K	Q	L	S	A	I	F	D	D	L	I	N	M	V	P	M	G	Q	T	L	F	G	S	L	N	P	V	R	T	G	G	P	M	Q	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?																?	?	?	?	?	?	?	?					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	A	F	A	E	Q	H	T	K	G	Y	P	W	K	M	D	G	T	V	R	Q	E	V	F	S	R	R	G	G	L	W	F	G	T	Y	H	L	L	N	Y	P	A	S	Y	S	A	P	I	Y	R	F	A	D	F	N	A	G	W	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	R	N	A	A	F	Q	N	A	V	S	K	A	S	G	V	K	L	A	L	D	G	D	L	I	R	Y	D	S	K	E	P	G	K	T	E	L	A	T	R	K	L	A	A	K	L	G	M	S	D	S	E	I	R	R	Q	L	E	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?												?	?													?	?	?	?	?	?													?	?	?	?										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	S	F	S	F	E	E	T	A	L	Y	K	K	V	Y	Q	L	A	E	T	K	T	G	K	S	L	P	R	E	M	L	P	G	I	Q	L	E	S	P	K	I	T	R	N	L	T	T	A	W	F	A	K	R	V	D	E	R	R	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?		?	?	?					?	?		?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.
Sequence		C	M	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand