Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39263 Date Thu Jan 5 11:58:35 GMT 2012 Unique Job ID 5e7feb89531d9af9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	A	I	T	E	S	K	P	T	R	R	W	A	M	P	D	T	L	V	I	I	F	F	V	A	I	L	T	S	L	A	T	W	V	V	P	V	G	M	F	D	S	Q	E	V	Q	Y	Q	V	D	G	Q	T	K	T	R	K	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	P	H	S	F	R	I	L	T	N	E	A	G	E	P	E	Y	H	R	V	Q	L	F	T	T	G	D	E	R	P	G	L	M	N	F	P	F	E	G	L	T	S	G	S	K	Y	G	T	A	V	G	I	I	M	F	M	L	V	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	A	F	G	I	V	M	R	T	G	T	I	D	N	G	I	L	A	L	I	R	H	T	R	G	N	E	I	L	F	I	P	A	L	F	I	L	F	S	L	G	G	A	V	F	G	M	G	E	E	A	V	A	F	A	I	I	I	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	M	V	R	L	G	Y	D	S	I	T	T	V	L	V	T	Y	I	A	T	Q	I	G	F	A	S	S	W	M	N	P	F	C	V	V	V	A	Q	G	I	A	G	V	P	V	L	S	G	S	G	L	R	I	V	V	W	V	I	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	I	G	L	I	F	T	M	V	Y	A	S	R	V	K	K	N	P	L	L	S	R	V	H	E	S	D	R	F	F	R	E	K	Q	A	D	V	E	Q	R	P	F	T	F	G	D	W	L	V	L	I	V	L	T	A	V	M	V	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	W	G	V	I	V	N	A	W	F	I	P	E	I	A	S	Q	F	F	T	M	G	L	V	I	G	I	I	G	V	V	F	R	L	N	G	M	T	V	N	T	M	A	S	S	F	T	E	G	A	R	M	M	I	A	P	A	L	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?																									?	?	?		?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	F	A	K	G	I	L	L	L	V	G	N	G	E	A	G	D	A	S	V	L	N	T	I	L	N	S	I	A	N	A	I	S	G	L	D	N	A	V	A	A	W	F	M	L	L	F	Q	A	V	F	N	F	F	V	T	S	G	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?															?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	A	A	L	T	M	P	L	L	A	P	L	G	D	L	V	G	V	N	R	Q	V	T	V	L	A	F	Q	F	G	D	G	F	S	H	I	I	Y	P	T	S	A	S	L	M	A	T	L	G	V	C	R	V	D	F	R	N	W	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	G	A	T	L	L	G	L	L	F	I	M	S	S	V	V	V	I	G	A	Q	L	M	G	Y	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand