Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P19926 Date Thu Jan 5 11:37:37 GMT 2012 Unique Job ID 5e6648266397b89e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	T	L	I	A	A	A	V	A	G	I	V	L	L	A	S	N	A	Q	A	Q	T	V	P	E	G	Y	Q	L	Q	Q	V	L	M	M	S	R	H	N	L	R	A	P	L	A	N	N	G	S	V	L	E	Q	S	T	P	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	P	E	W	D	V	P	G	G	Q	L	T	T	K	G	G	V	L	E	V	Y	M	G	H	Y	M	R	E	W	L	A	E	Q	G	M	V	K	S	G	E	C	P	P	P	Y	T	V	Y	A	Y	A	N	S	L	Q	R	T	V	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	Q	F	F	I	T	G	A	F	P	G	C	D	I	P	V	H	H	Q	E	K	M	G	T	M	D	P	T	F	N	P	V	I	T	D	D	S	A	A	F	S	E	Q	A	V	A	A	M	E	K	E	L	S	K	L	Q	L	T	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	Q	L	L	E	K	I	V	N	Y	K	D	S	P	A	C	K	E	K	Q	Q	C	S	L	V	D	G	K	N	T	F	S	A	K	Y	Q	Q	E	P	G	V	S	G	P	L	K	V	G	N	S	L	V	D	A	F	T	L	Q	Y	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	G	F	P	M	D	Q	V	A	W	G	E	I	K	S	D	Q	Q	W	K	V	L	S	K	L	K	N	G	Y	Q	D	S	L	F	T	S	P	E	V	A	R	N	V	A	K	P	L	V	S	Y	I	D	K	A	L	V	T	D	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?						?															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	A	P	K	I	T	V	L	V	G	H	D	S	N	I	A	S	L	L	T	A	L	D	F	K	P	Y	Q	L	H	D	Q	N	E	R	T	P	I	G	G	K	I	V	F	Q	R	W	H	D	S	K	A	N	R	D	L	M	K	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Sequence		Y	V	Y	Q	S	A	E	Q	L	R	N	A	D	A	L	T	L	Q	A	P	A	Q	R	V	T	L	E	L	S	G	C	P	I	D	A	D	G	F	C	P	M	D	K	F	D	S	V	L	N	E	A	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?		?		?	?		?	?	?					?	?													?																	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand