Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33226 Date Thu Jan 5 11:51:25 GMT 2012 Unique Job ID 5d916efdee91563b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	K	L	W	N	A	L	R	R	P	S	A	R	W	S	V	L	A	L	V	A	I	G	I	V	I	G	I	A	L	I	V	L	P	H	V	G	I	K	V	T	S	T	T	E	F	C	V	S	C	H	S	M	Q	P	V	Y	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	K	Q	S	V	H	F	Q	N	A	S	G	V	R	A	E	C	H	D	C	H	I	P	P	D	I	P	G	M	V	K	R	K	L	E	A	S	N	D	I	Y	Q	T	F	I	A	H	S	I	D	T	P	E	K	F	E	A	K	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?		?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	L	A	E	R	E	W	A	R	M	K	E	N	N	S	A	T	C	R	S	C	H	N	Y	D	A	M	D	H	A	K	Q	H	P	E	A	A	R	Q	M	K	V	A	A	K	D	N	Q	S	C	I	D	C	H	K	G	I	A	H	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?														?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	P	D	M	S	S	G	F	R	K	Q	F	D	E	L	R	A	S	A	N	D	S	G	D	T	L	Y	S	I	D	I	K	P	I	Y	A	A	K	G	D	K	E	A	S	G	S	L	L	P	A	S	E	V	K	V	L	K	R	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																?	?	?	?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	W	L	Q	I	E	I	T	G	W	T	E	S	A	G	R	Q	R	V	L	T	Q	F	P	G	K	R	I	F	V	A	S	I	R	G	D	V	Q	Q	Q	V	K	T	L	E	K	T	T	V	A	D	T	N	T	E	W	S	K	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																																						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	T	A	W	M	K	K	G	D	M	V	N	D	I	K	P	I	W	A	Y	A	D	S	L	Y	N	G	T	C	N	Q	C	H	G	A	P	E	I	A	H	F	D	A	N	G	W	I	G	T	L	N	G	M	I	G	F	T	S	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?					?																										?	?	?	?	?	?															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Sequence		K	R	E	E	R	T	L	L	K	Y	L	Q	M	N	A	S	D	T	A	G	K	A	H	G	D	K	K	E	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand