Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33346 Date Thu Jan 5 11:51:48 GMT 2012 Unique Job ID 5d0884c69ccdca6e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	D	K	E	L	P	W	L	A	D	N	A	Q	L	E	L	K	Y	K	K	G	K	T	P	L	S	H	R	R	W	P	G	E	P	V	S	V	I	T	G	S	L	I	Q	T	L	G	D	E	L	L	Q	K	A	E	K	K	K	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?													?							?	?	?					?	?	?	?	?													?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	W	R	Y	E	N	F	S	L	E	W	Q	S	A	I	T	Q	A	I	N	L	I	G	E	H	K	P	S	I	P	A	R	T	M	A	A	L	A	C	I	A	Q	N	D	S	Q	Q	L	L	D	E	I	V	Q	Q	E	G	L	E	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	T	E	V	V	I	A	R	Q	F	I	A	R	C	Y	E	S	D	P	L	V	V	T	L	Q	Y	Q	D	E	D	Y	G	Y	G	Y	R	S	E	T	Y	N	E	F	D	L	R	L	R	K	H	L	S	L	A	E	E	S	C	W	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	C	A	D	K	L	I	A	A	L	P	G	I	N	K	V	R	R	P	F	I	A	L	I	L	P	E	K	P	E	I	A	N	E	L	V	G	L	E	C	P	R	T	H	F	H	S	K	E	W	L	K	V	V	A	N	D	P	T	A
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Disorder										?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	R	K	L	E	H	Y	W	S	Q	D	I	F	S	D	R	E	A	S	Y	M	S	H	E	N	H	F	G	Y	A	A	C	A	A	L	L	R	E	Q	G	L	A	A	I	P	R	L	A	M	Y	A	H	K	E	D	C	G	S	L	L
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Disorder																																								?						?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Q	I	N	H	P	Q	V	I	R	T	L	L	L	V	A	D	K	N	K	P	S	L	Q	R	V	A	K	Y	H	K	N	F	P	H	A	T	L	A	A	L	A	E	L	L	A	L	T	E	P	P	A	R	P	G	Y	P	I	I	E
Secondary structure
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Disorder								?	?	?				?	?	?	?	?	?	?		?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	K	K	L	P	A	Q	Q	K	A	R	D	E	Y	W	R	T	L	L	Q	T	L	M	A	S	Q	P	Q	L	A	A	E	V	M	P	W	L	S	T	Q	P	Q	S	V	L	K	S	Y	L	S	A	P	P	K	P	V	I	D	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?											?	?	?	?	?	?	?											?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		D	N	S	N	L	P	E	I	L	V	S	P	P	W	R	S	K	K	K	M	T	A	P	R	L	D	L	A	P	L	E	L	T	P	Q	V	Y	W	Q	P	G	E	Q	E	R	L	A	A	T	E	P	A	R	Y	F	S	T	E	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	Q	R	M	E	Q	K	S	G	R	V	V	L	Q	E	L	G	F	G	D	D	V	W	L	F	L	N	Y	I	L	P	G	K	L	D	A	A	R	N	S	L	F	V	Q	W	H	Y	Y	Q	G	R	V	E	E	I	L	N	G	W	N
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	P	E	A	Q	L	A	E	Q	A	L	R	S	G	H	I	E	A	L	I	N	I	W	E	N	D	N	Y	S	H	Y	R	P	E	K	S	V	W	N	L	Y	L	L	A	Q	L	P	R	E	M	A	L	T	F	W	L	R	I	N	E
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?									?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		K	K	H	L	F	A	G	E	D	Y	F	L	S	I	L	G	L	D	A	L	P	G	L	L	L	A	F	S	H	R	P	K	E	T	F	P	L	I	L	N	F	G	A	T	E	L	A	L	P	V	A	H	V	W	R	R	F	A	A	Q
Secondary structure
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Disorder																																																											?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		R	D	L	A	R	Q	W	I	L	Q	W	P	E	H	T	A	S	A	L	I	P	L	V	F	T	K	P	S	D	N	S	E	A	A	L	L	A	L	R	L	L	Y	E	Q	G	H	G	E	L	L	Q	T	V	A	N	R	W	Q	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	V	W	S	A	L	E	Q	L	L	K	Q	G	P	M	D	I	Y	P	A	R	I	P	K	A	P	D	F	W	H	P	Q	M	W	S	R	P	R	L	I	T	N	N	Q	T	V	T	N	D	A	L	E	I	I	G	E	M	L	R	F
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SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		T	Q	G	G	R	F	Y	S	G	L	E	Q	L	K	T	F	C	Q	P	Q	T	L	A	A	F	A	W	D	L	F	T	A	W	Q	Q	A	G	A	P	A	K	D	N	W	A	F	L	A	L	S	L	F	G	D	E	S	T	A	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		L	T	T	Q	I	L	A	W	P	Q	E	G	K	S	A	R	A	V	S	G	L	N	I	L	T	L	M	N	N	D	M	A	L	I	Q	L	H	H	I	S	Q	R	A	K	S	R	P	L	R	D	N	A	A	E	F	L	Q	V	V	A
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SS confidence
Disorder											?	?	?	?															?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		E	N	R	G	L	S	Q	E	E	L	A	D	R	L	V	P	T	L	G	L	D	D	P	Q	A	L	S	F	D	F	G	P	R	Q	F	T	V	R	F	D	E	N	L	N	P	V	I	F	D	Q	Q	N	V	R	Q	K	S	V	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?																																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		L	R	A	D	D	D	Q	L	K	A	P	E	A	L	A	R	L	K	G	L	K	K	D	A	T	Q	V	S	K	N	L	L	P	R	L	E	T	A	L	R	T	T	R	R	W	S	L	A	D	F	H	S	L	F	V	N	H	P	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		R	L	V	T	Q	R	L	I	W	G	V	Y	P	A	N	E	P	R	C	L	L	K	A	F	R	V	A	A	E	G	E	F	C	N	A	Q	D	E	P	I	D	L	P	A	D	A	L	I	G	I	A	H	P	L	E	M	T	A	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		R	S	E	F	A	Q	L	F	A	D	Y	E	I	M	P	P	F	R	Q	L	S	R	R	T	V	L	L	T	P	D	E	S	T	S	N	S	L	T	R	W	E	G	K	S	A	T	V	G	Q	L	M	G	M	R	Y	K	G	W	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?		?	?																			?		?	?
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Sequence		G	Y	E	D	A	F	V	Y	N	L	G	E	Y	R	L	V	L	K	F	S	P	G	F	N	H	Y	N	V	D	S	K	A	L	M	S	F	R	S	L	R	V	Y	R	D	N	K	S	V	T	F	A	E	L	D	V	F	D	L	S	E
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SS confidence
Disorder		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210
Sequence		A	L	S	A	P	D	V	I	F	H
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