Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76216 Date Thu Jan 5 12:20:40 GMT 2012 Unique Job ID 5d0247ce2fe6dce9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	A	W	E	V	N	F	D	G	L	V	G	L	T	H	H	Y	A	G	L	S	F	G	N	E	A	S	T	R	H	R	F	Q	V	S	N	P	R	L	A	A	K	Q	G	L	L	K	M	K	A	L	A	D	A	G	F	P	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	I	P	P	H	E	R	P	F	I	P	V	L	R	Q	L	G	F	S	G	S	D	E	Q	V	L	E	K	V	A	R	Q	A	P	H	W	L	S	S	V	S	S	A	S	P	M	W	V	A	N	A	A	T	I	A	P	S	A	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?																											?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	D	G	K	V	H	L	T	V	A	N	L	N	N	K	F	H	R	S	L	E	A	P	V	T	E	S	L	L	K	A	I	F	N	D	E	E	K	F	S	V	H	S	A	L	P	Q	V	A	L	L	G	D	E	G	A	A	N	H	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?																										?	?	?	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	L	G	G	H	Y	G	E	P	G	M	Q	L	F	V	Y	G	R	E	E	G	N	D	T	R	P	S	R	Y	P	A	R	Q	T	R	E	A	S	E	A	V	A	R	L	N	Q	V	N	P	Q	Q	V	I	F	A	Q	Q	N	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	I	D	Q	G	V	F	H	N	D	V	I	A	V	S	N	R	Q	V	L	F	C	H	Q	Q	A	F	A	R	Q	S	Q	L	L	A	N	L	R	A	R	V	N	G	F	M	A	I	E	V	P	A	T	Q	V	S	V	S	D	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																																																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	T	Y	L	F	N	S	Q	L	L	S	R	D	D	G	S	M	M	L	V	L	P	Q	E	C	R	E	H	A	G	V	W	G	Y	L	N	E	L	L	A	A	D	N	P	I	S	E	L	K	V	F	D	L	R	E	S	M	A	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?															?	?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	G	P	A	C	L	R	L	R	V	V	L	T	E	E	E	R	R	A	V	N	P	A	V	M	M	N	D	T	L	F	N	A	L	N	D	W	V	D	R	Y	Y	R	D	R	L	T	A	A	D	L	A	D	P	Q	L	L	R	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?						?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	E	A	L	D	V	L	S	Q	L	L	N	L	G	S	V	Y	P	F	Q	R	E	G	G	G	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand