Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33129 Date Thu Jan 5 11:51:11 GMT 2012 Unique Job ID 5cb874abd1bc9ab6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	I	E	Y	T	K	N	Y	H	H	L	T	R	I	A	T	F	C	A	L	L	Y	C	N	T	A	F	S	A	E	L	V	E	Y	D	H	T	F	L	M	G	Q	N	A	S	N	I	D	L	S	R	Y	S	E	G	N	P	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																?																?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	G	V	Y	D	V	S	V	Y	V	N	D	Q	P	I	I	N	Q	S	I	T	F	V	A	I	E	G	K	K	N	A	Q	A	C	I	T	L	K	N	L	L	Q	F	H	I	N	S	P	D	I	N	N	E	K	A	V	L	L	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																										?																							?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	E	T	L	G	N	C	L	N	L	T	E	I	I	P	Q	A	S	V	R	Y	D	V	N	D	Q	R	L	D	I	D	V	P	Q	A	W	V	M	K	N	Y	Q	N	Y	V	D	P	S	L	W	E	N	G	I	N	A	A	M	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																														?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	N	L	N	G	Y	H	S	E	T	P	G	R	K	N	E	S	I	Y	A	A	F	N	G	G	M	N	L	G	A	W	R	L	R	A	S	G	N	Y	N	W	M	T	D	S	G	S	N	Y	D	F	K	N	R	Y	V	Q	R	D	I
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SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	S	L	R	S	Q	L	I	L	G	E	S	Y	T	T	G	E	T	F	D	S	V	S	I	R	G	I	R	L	Y	S	D	S	R	M	L	P	P	T	L	A	S	F	A	P	I	I	H	G	V	A	N	T	N	A	K	V	T	I	T
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Disorder			?	?							?				?	?		?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	G	G	Y	K	I	Y	E	T	T	V	P	P	G	A	F	V	I	D	D	L	S	P	S	G	Y	G	S	D	L	I	V	T	I	E	E	S	D	G	S	K	R	T	F	S	Q	P	F	S	S	V	V	Q	M	L	R	P	G	V	G
Secondary structure
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Disorder																?						?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	W	D	I	S	G	G	Q	V	L	K	D	D	I	Q	D	E	P	N	L	F	Q	A	S	Y	Y	Y	G	L	N	N	Y	L	T	G	Y	T	G	I	Q	I	T	D	N	N	Y	T	A	G	L	L	G	L	G	L	N	T	S	V	G
Secondary structure
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Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	F	S	F	D	V	T	H	S	N	V	R	I	P	D	D	K	T	Y	Q	G	Q	S	Y	R	V	S	W	N	K	L	F	E	E	T	S	T	S	L	N	I	A	A	Y	R	Y	S	T	Q	N	Y	L	G	L	N	D	A	L	T	L
Secondary structure
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Disorder										?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?									?			?		?							?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	D	E	V	K	H	P	E	Q	D	L	E	P	K	S	M	R	N	Y	S	R	M	K	N	Q	V	T	V	S	I	N	Q	P	L	K	F	E	K	K	D	Y	G	S	F	Y	L	S	G	S	W	S	D	Y	W	A	S	G	Q	N	R
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?														?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	N	Y	S	I	G	Y	S	N	S	T	S	W	G	S	Y	S	V	S	A	Q	R	S	W	N	E	D	G	D	T	D	D	S	V	Y	L	S	F	T	I	P	I	E	K	L	L	G	T	E	Q	R	T	S	G	F	Q	S	I	D	T
Secondary structure
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	I	S	S	D	F	K	G	N	N	Q	L	N	V	S	S	S	G	Y	S	D	N	A	R	V	S	Y	S	V	N	T	G	Y	T	M	N	K	A	S	K	D	L	S	Y	V	G	G	Y	A	S	Y	E	S	P	W	G	T	L	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?		?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		S	I	S	A	N	S	D	N	S	R	Q	V	S	L	S	T	D	G	G	F	V	L	H	S	G	G	L	T	F	S	N	D	S	F	S	D	S	D	T	L	A	V	V	Q	A	P	G	A	Q	G	A	R	I	N	Y	G	N	S	T	I
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	R	W	G	Y	G	V	T	S	A	L	S	P	Y	H	E	N	R	I	A	L	D	I	N	D	L	E	N	D	V	E	L	K	S	T	S	A	V	A	V	P	R	Q	G	S	V	V	F	A	D	F	E	T	V	Q	G	Q	S	A	I
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		M	N	I	T	R	S	D	G	K	N	I	P	F	A	A	D	I	Y	D	E	Q	G	N	V	I	G	N	V	G	Q	G	G	Q	A	F	V	R	G	I	E	Q	Q	G	N	I	S	I	K	W	L	E	Q	S	K	P	V	S	C	L	A
Secondary structure
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Disorder																																										?	?	?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.
Sequence		H	Y	Q	Q	S	P	E	A	E	K	I	A	Q	S	I	I	L	N	G	I	R	C	Q	I	Q
Secondary structure
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Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?						?				?	?	?
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