Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39830 Date Thu Jan 5 12:00:54 GMT 2012 Unique Job ID 5c57c77774bb0da5

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	H	H	A	T	P	L	I	T	T	I	V	G	G	L	V	L	A	F	I	L	G	M	L	A	N	K	L	R	I	S	P	L	V	G	Y	L	L	A	G	V	L	A	G	P	F	T	P	G	F	V	A	D	T	K	L	A	P	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	E	L	G	V	I	L	L	M	F	G	V	G	L	H	F	S	L	K	D	L	M	A	V	K	A	I	A	I	P	G	A	I	A	Q	I	A	V	A	T	L	L	G	M	A	L	S	A	V	L	G	W	S	L	M	T	G	I	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	L	C	L	S	T	A	S	T	V	V	L	L	R	A	L	E	E	R	Q	L	I	D	S	Q	R	G	Q	I	A	I	G	W	L	I	V	E	D	L	V	M	V	L	T	L	V	L	L	P	A	V	A	G	M	M	E	Q	G	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	F	A	T	L	A	V	D	M	G	I	T	I	G	K	V	I	A	F	I	A	I	M	M	L	V	G	R	R	L	V	P	W	I	M	A	R	S	A	A	T	G	S	R	E	L	F	T	L	S	V	L	A	L	A	L	G	V	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	A	V	E	L	F	D	V	S	F	A	L	G	A	F	F	A	G	M	V	L	N	E	S	E	L	S	H	R	A	A	H	D	T	L	P	L	R	D	A	F	A	V	L	F	F	V	S	V	G	M	L	F	D	P	L	I	L	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	P	L	A	V	L	A	T	L	A	I	I	L	F	G	K	S	L	A	A	F	F	L	V	R	L	F	G	H	S	Q	R	T	A	L	T	I	A	A	S	L	A	Q	I	G	E	F	A	F	I	L	A	G	L	G	M	A	L	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	P	Q	A	G	Q	N	L	V	L	A	G	A	I	L	S	I	M	L	N	P	V	L	F	A	L	L	E	K	Y	L	A	K	T	E	T	L	E	E	Q	T	L	E	E	A	I	E	E	E	K	Q	I	P	V	D	I	C	N	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	L	V	G	Y	G	R	V	G	S	L	L	G	E	K	L	L	A	S	D	I	P	L	V	V	I	E	T	S	R	T	R	V	D	E	L	R	E	R	G	V	R	A	V	L	G	N	A	A	N	E	E	I	M	Q	L	A	H	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		C	A	K	W	L	I	L	T	I	P	N	G	Y	E	A	G	E	I	V	A	S	A	R	A	K	N	P	D	I	E	I	I	A	R	A	H	Y	D	D	E	V	A	Y	I	T	E	R	G	A	N	Q	V	V	M	G	E	R	E	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	T	M	L	E	L	L	E	T	P	P	A	G	E	V	V	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand