Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A903 Date Thu Jan 5 11:09:04 GMT 2012 Unique Job ID 5b866f83dc8a531a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	Y	S	V	Q	K	S	R	L	A	K	V	A	G	V	S	L	V	L	L	L	A	A	C	S	S	D	S	R	Y	K	R	Q	V	S	G	D	E	A	Y	L	E	A	A	P	L	A	E	L	H	A	P	A	G	M	I	L	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?														?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	S	G	D	Y	A	I	P	V	T	N	G	S	G	A	V	G	K	A	L	D	I	R	P	P	A	Q	P	L	A	L	V	S	G	A	R	T	Q	F	T	G	D	T	A	S	L	L	V	E	N	G	R	G	N	T	L	W	P	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	S	V	L	Q	A	K	N	Y	T	I	T	Q	R	D	D	A	G	Q	T	L	T	T	D	W	V	Q	W	N	R	L	D	E	D	E	Q	Y	R	G	R	Y	Q	I	S	V	K	P	Q	G	Y	Q	Q	A	V	T	V	K	L	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	E	Q	A	G	K	P	V	A	D	A	A	S	M	Q	R	Y	S	T	E	M	M	N	V	I	S	A	G	L	D	K	S	A	T	D	A	A	N	A	A	Q	N	R	A	S	T	T	M	D	V	Q	S	A	A	D	D	T	G	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?	?		?	?		?	?																	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	L	V	V	R	G	P	F	N	V	V	W	Q	R	L	P	A	A	L	E	K	V	G	M	K	V	T	D	S	T	R	S	Q	G	N	M	A	V	T	Y	K	P	L	S	D	S	D	W	Q	E	L	G	A	S	D	P	G	L	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Sequence		G	D	Y	K	L	Q	V	G	D	L	D	N	R	S	S	L	Q	F	I	D	P	K	G	H	T	L	T	Q	S	Q	N	D	A	L	V	A	V	F	Q	A	A	F	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?								?	?										?	?	?	?	?	?	?																?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand