Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q46901 Date Thu Jan 5 12:35:40 GMT 2012 Unique Job ID 5ae3c8b85df24dbc

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	L	L	I	D	N	W	I	P	V	R	P	R	N	G	G	K	V	Q	I	I	N	L	Q	S	L	Y	C	S	R	D	Q	W	R	L	S	L	P	R	D	D	M	E	L	A	A	L	A	L	L	V	C	I	G	Q	I	I	A	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?									?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	K	D	D	V	E	F	R	H	R	I	M	N	P	L	T	E	D	E	F	Q	Q	L	I	A	P	W	I	D	M	F	Y	L	N	H	A	E	H	P	F	M	Q	T	K	G	V	K	A	N	D	V	T	P	M	E	K	L	L	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?		?	?	?	?	?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	S	G	A	T	N	C	A	F	V	N	Q	P	G	Q	G	E	A	L	C	G	G	C	T	A	I	A	L	F	N	Q	A	N	Q	A	P	G	F	G	G	G	F	K	S	G	L	R	G	G	T	P	V	T	T	F	V	R	G	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	R	S	T	V	L	L	N	V	L	T	L	P	R	L	Q	K	Q	F	P	N	E	S	H	T	E	N	Q	P	T	W	I	K	P	I	K	S	N	E	S	I	P	A	S	S	I	G	F	V	R	G	L	F	W	Q	P	A	H	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	C	D	P	I	G	I	G	K	C	S	C	C	G	Q	E	S	N	L	R	Y	T	G	F	L	K	E	K	F	T	F	T	V	N	G	L	W	P	H	P	H	S	P	C	L	V	T	V	K	K	G	E	V	E	E	K	F	L	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?				?															?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	T	S	A	P	S	W	T	Q	I	S	R	V	V	V	D	K	I	I	Q	N	E	N	G	N	R	V	A	A	V	V	N	Q	F	R	N	I	A	P	Q	S	P	L	E	L	I	M	G	G	Y	R	N	N	Q	A	S	I	L	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	H	D	V	L	M	F	N	Q	G	W	Q	Q	Y	G	N	V	I	N	E	I	V	T	V	G	L	G	Y	K	T	A	L	R	K	A	L	Y	T	F	A	E	G	F	K	N	K	D	F	K	G	A	G	V	S	V	H	E	T	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?																											?		?		?	?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	H	F	Y	R	Q	S	E	L	L	I	P	D	V	L	A	N	V	N	F	S	Q	A	D	E	V	I	A	D	L	R	D	K	L	H	Q	L	C	E	M	L	F	N	Q	S	V	A	P	Y	A	H	H	P	K	L	I	S	T	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Sequence		L	A	R	A	T	L	Y	K	H	L	R	E	L	K	P	Q	G	G	P	S	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand