Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AGC0 Date Thu Jan 5 11:28:42 GMT 2012 Unique Job ID 5ae1fe943ab46571

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	A	F	L	N	Q	V	R	K	P	T	L	D	L	P	L	E	V	R	R	K	M	W	F	K	P	F	M	Q	S	Y	L	V	V	F	I	G	Y	L	T	M	Y	L	I	R	K	N	F	N	I	A	Q	N	D	M	I	S	T	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	L	S	M	T	Q	L	G	M	I	G	L	G	F	S	I	T	Y	G	V	G	K	T	L	V	S	Y	Y	A	D	G	K	N	T	K	Q	F	L	P	F	M	L	I	L	S	A	I	C	M	L	G	F	S	A	S	M	G	S	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	S	L	F	L	M	I	A	F	Y	A	L	S	G	F	F	Q	S	T	G	G	S	C	S	Y	S	T	I	T	K	W	T	P	R	R	K	R	G	T	F	L	G	F	W	N	I	S	H	N	L	G	G	A	G	A	A	G	V	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	G	A	N	Y	L	F	D	G	H	V	I	G	M	F	I	F	P	S	I	I	A	L	I	V	G	F	I	G	L	R	Y	G	S	D	S	P	E	S	Y	G	L	G	K	A	E	E	L	F	G	E	E	I	S	E	E	D	K	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	S	T	D	M	T	K	W	Q	I	F	V	E	Y	V	L	K	N	K	V	I	W	L	L	C	F	A	N	I	F	L	Y	V	V	R	I	G	I	D	Q	W	S	T	V	Y	A	F	Q	E	L	K	L	S	K	A	V	A	I	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	T	L	F	E	A	G	A	L	V	G	T	L	L	W	G	W	L	S	D	L	A	N	G	R	R	G	L	V	A	C	I	A	L	A	L	I	I	A	T	L	G	V	Y	Q	H	A	S	N	E	Y	I	Y	L	A	S	L	F	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	F	L	V	F	G	P	Q	L	L	I	G	V	A	A	V	G	F	V	P	K	K	A	I	G	A	A	D	G	I	K	G	T	F	A	Y	L	I	G	D	S	F	A	K	L	G	L	G	M	I	A	D	G	T	P	V	F	G	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Sequence		G	W	A	G	T	F	A	A	L	D	I	A	A	I	G	C	I	C	L	M	A	I	V	A	V	M	E	E	R	K	I	R	R	E	K	K	I	Q	Q	L	T	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand