Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76393 Date Thu Jan 5 12:22:31 GMT 2012 Unique Job ID 5ad4a4f128b5400a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	N	I	K	V	F	T	S	T	G	E	L	T	T	L	G	R	E	L	G	K	G	G	E	G	A	V	Y	D	I	E	E	F	V	D	S	V	A	K	I	Y	H	T	P	P	P	A	L	K	Q	D	K	L	A	F	M	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?	?	?	?	?										?		?																									?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	A	D	A	Q	L	L	N	Y	V	A	W	P	Q	A	T	L	H	G	G	R	G	G	K	V	I	G	F	M	M	P	K	V	S	G	K	E	P	I	H	M	I	Y	S	P	A	H	R	R	Q	S	Y	P	H	C	A	W	D	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																						?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	Y	V	A	R	N	I	A	S	S	F	A	T	V	H	E	H	G	H	V	V	G	D	V	N	Q	N	S	F	M	V	G	R	D	S	K	V	V	L	I	D	S	D	S	F	Q	I	N	A	N	G	T	L	H	L	C	E	V	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	H	F	T	P	P	E	L	Q	T	L	P	S	F	V	G	F	E	R	T	E	N	H	D	N	F	G	L	A	L	L	I	F	H	V	L	F	G	G	R	H	P	Y	S	G	V	P	L	I	S	D	A	G	N	A	L	E	T	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?																													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	H	F	R	Y	A	Y	A	S	D	N	Q	R	R	G	L	K	P	P	P	R	S	I	P	L	S	M	L	P	S	D	V	E	A	M	F	Q	Q	A	F	T	E	S	G	V	A	T	G	R	P	T	A	K	A	W	V	A	A	L	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?		?																							?		?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	L	R	Q	Q	L	K	K	C	I	V	S	A	M	H	V	Y	P	A	H	L	T	D	C	P	W	C	A	L	D	N	Q	G	V	I	Y	F	I	D	L	G	E	E	V	I	T	T	G	G	N	F	V	L	A	K	V	W	A	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?				?															?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	A	S	V	A	P	P	A	L	Q	L	P	L	P	D	H	F	Q	P	T	G	R	P	L	P	L	G	L	L	R	R	E	Y	I	I	L	L	E	I	A	L	S	A	L	S	L	L	L	C	G	L	Q	A	E	P	R	Y	I	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	P	V	L	A	A	I	W	I	I	G	S	L	T	S	K	A	Y	K	A	E	V	Q	Q	R	R	E	A	F	N	R	A	K	M	D	Y	D	H	L	V	R	Q	I	Q	Q	V	G	G	L	E	G	F	I	A	K	R	T	M	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		K	M	K	D	E	I	L	G	L	P	E	E	E	K	R	A	L	A	A	L	H	D	T	A	R	E	R	Q	K	Q	K	F	L	E	G	F	F	I	D	V	A	S	I	P	G	V	G	P	A	R	K	A	A	L	R	S	F	G	I	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	A	A	D	V	T	R	R	G	V	K	Q	V	K	G	F	G	D	H	L	T	Q	A	V	I	D	W	K	A	S	C	E	R	R	F	V	F	R	P	N	E	A	I	T	P	A	D	R	Q	A	V	M	A	K	M	T	A	K	R	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?							?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		R	L	E	S	A	L	T	V	G	A	T	E	L	Q	R	F	R	L	H	A	P	A	R	T	M	P	L	M	E	P	L	R	Q	A	A	E	K	L	A	Q	A	Q	A	D	L	S	R	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand