Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76104 Date Thu Jan 5 12:18:59 GMT 2012 Unique Job ID 5a7e5330791bc35c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	V	S	S	H	R	L	E	L	L	S	P	A	R	D	A	A	I	A	R	E	A	I	L	H	G	A	D	A	V	Y	I	G	G	P	G	F	G	A	R	H	N	A	S	N	S	L	K	D	I	A	E	L	V	P	F	A	H	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																			?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Y	G	A	K	I	F	V	T	L	N	T	I	L	H	D	D	E	L	E	P	A	Q	R	L	I	T	D	L	Y	Q	T	G	V	D	A	L	I	V	Q	D	M	G	I	L	E	L	D	I	P	P	I	E	L	H	A	S	T	Q	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	R	T	V	E	K	A	K	F	L	S	D	V	G	F	T	Q	I	V	L	A	R	E	L	N	L	D	Q	I	R	A	I	H	Q	A	T	D	A	T	I	E	F	F	I	H	G	A	L	C	V	A	Y	S	G	Q	C	Y	I	S	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	Q	T	G	R	S	A	N	R	G	D	C	S	Q	A	C	R	L	P	Y	T	L	K	D	D	Q	G	R	V	V	S	Y	E	K	H	L	L	S	M	K	D	N	D	Q	T	A	N	L	G	A	L	I	D	A	G	V	R	S	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?		?														?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	E	G	R	Y	K	D	M	S	Y	V	K	N	I	T	A	H	Y	R	Q	M	L	D	A	I	I	E	E	R	G	D	L	A	R	A	S	S	G	R	T	E	H	F	F	V	P	S	T	E	K	T	F	H	R	G	S	T	D	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	N	A	R	K	G	D	I	G	A	F	D	S	P	K	F	I	G	L	P	V	G	E	V	V	K	V	A	K	D	H	L	D	V	A	V	T	E	P	L	A	N	G	D	G	L	N	V	L	I	K	R	E	V	V	G	F	R	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	V	E	K	T	G	E	N	Q	Y	R	V	W	P	N	E	M	P	A	D	L	H	K	I	R	P	H	H	P	L	N	R	N	L	D	H	N	W	Q	Q	A	L	T	K	T	S	S	E	R	R	V	A	V	D	I	E	L	G	G	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?														?							?		?																?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	E	Q	L	I	L	T	L	T	S	E	E	G	V	S	I	T	H	T	L	D	G	Q	F	D	E	A	N	N	A	E	K	A	M	N	N	L	K	D	G	L	A	K	L	G	Q	T	L	Y	Y	A	R	D	V	Q	I	N	L	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	L	F	V	P	N	S	L	L	N	Q	F	R	R	E	A	A	D	M	L	D	A	A	R	L	A	S	Y	Q	R	G	S	R	K	P	V	A	D	P	A	P	V	Y	P	Q	T	H	L	S	F	L	A	N	V	Y	N	Q	K	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	F	Y	H	R	Y	G	V	Q	L	I	D	A	A	Y	E	A	H	E	E	K	G	E	V	P	V	M	I	T	K	H	C	L	R	F	A	F	N	L	C	P	K	Q	A	K	G	N	I	K	S	W	K	A	T	P	M	Q	L	V	N
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
Sequence		G	D	E	V	L	T	L	K	F	D	C	R	P	C	E	M	H	V	I	G	K	I	K	N	H	I	L	K	M	P	L	P	G	S	V	V	A	S	V	S	P	D	E	L	L	K	T	L	P	K	R	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand