Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77196 Date Thu Jan 5 12:26:13 GMT 2012 Unique Job ID 5a7be65cbccb238f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	D	H	S	L	F	R	L	R	I	L	P	W	C	I	A	L	A	M	S	G	S	Y	S	S	V	W	A	E	D	D	I	Q	F	D	S	R	F	L	E	L	K	G	D	T	K	I	D	L	K	R	F	S	S	Q	G	Y	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?		?														?	?	?	?	?	?	?	?	?						?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	G	K	Y	N	L	Q	V	Q	L	N	K	Q	P	L	A	E	E	Y	D	I	Y	W	Y	A	G	E	D	D	V	S	K	S	Y	A	C	L	T	P	E	L	V	A	Q	F	G	L	K	E	D	V	A	K	N	L	Q	W	S	H	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																										?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	K	C	L	K	P	G	Q	L	E	G	V	E	I	K	A	D	L	S	Q	S	A	L	V	I	S	L	P	Q	A	Y	L	E	Y	T	W	P	D	W	D	P	P	S	R	W	D	D	G	I	S	G	I	I	A	D	Y	S	I	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	T	R	H	E	E	N	G	G	D	D	S	N	E	I	S	G	N	G	T	V	G	V	N	L	G	P	W	R	M	R	A	D	W	Q	T	N	Y	Q	H	T	R	S	N	D	D	D	D	E	F	G	G	D	D	T	Q	K	K	W	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?																?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	S	R	Y	Y	A	W	R	A	L	P	S	L	K	A	K	L	A	L	G	E	D	Y	L	N	S	D	I	F	D	G	F	N	Y	V	G	G	S	V	S	T	D	D	Q	M	L	P	P	N	L	R	G	Y	A	P	D	I	S	G	V
Secondary structure
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Disorder														?							?				?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	H	T	T	A	K	V	T	V	S	Q	M	G	R	V	I	Y	E	T	Q	V	P	A	G	P	F	R	I	Q	D	L	G	D	S	V	S	G	T	L	H	I	R	I	E	E	Q	N	G	Q	V	Q	E	Y	D	I	S	T	A	S	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																											?	?			?	?	?																								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	Y	L	T	R	P	G	Q	V	R	Y	K	I	M	M	G	R	P	Q	E	W	G	H	H	V	E	G	G	F	F	S	G	A	E	A	S	W	G	I	A	N	G	W	S	L	Y	G	G	A	L	G	D	E	N	Y	Q	S	A	A	L
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	V	G	R	D	L	S	T	F	G	A	V	A	F	D	V	T	H	S	H	T	K	L	D	K	D	T	A	Y	G	K	G	S	L	D	G	N	S	F	R	V	S	Y	S	K	D	F	D	Q	L	N	S	R	V	T	F	A	G	Y	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?			?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	S	E	E	N	F	M	T	M	S	E	Y	L	D	A	S	D	S	E	M	V	R	T	G	N	D	K	E	M	Y	T	A	T	Y	N	Q	N	F	R	D	A	G	V	S	V	Y	L	N	Y	T	R	H	T	Y	W	D	R	E	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?											?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?												?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	N	Y	N	I	M	L	S	H	Y	F	N	M	G	S	I	R	N	M	S	V	S	L	T	G	Y	R	Y	E	Y	D	N	R	A	D	K	G	M	Y	I	S	L	S	M	P	W	G	D	N	S	T	V	S	Y	N	G	N	Y	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?										?		?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	T	D	S	S	Q	V	G	Y	F	S	R	V	D	D	A	T	H	Y	Q	L	N	I	G	T	S	D	K	H	T	S	V	D	G	Y	Y	S	H	D	G	S	L	A	Q	V	D	L	S	A	N	Y	H	E	G	Q	Y	T	S	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		L	S	L	Q	G	G	A	T	L	T	T	H	G	G	A	L	H	R	T	Q	N	M	G	G	T	R	L	L	I	D	A	D	G	V	A	D	V	P	V	E	G	N	G	A	A	V	Y	T	N	M	F	G	K	A	V	V	S	D	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?			?	?	?	?										?	?		?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		N	Y	Y	R	N	Q	A	Y	I	D	L	N	K	L	P	E	N	A	E	A	T	Q	S	V	V	Q	A	T	L	T	E	G	A	I	G	Y	R	K	F	A	V	I	S	G	Q	K	A	M	A	V	L	R	L	Q	D	G	S	H	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?											?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		F	G	A	E	V	K	N	D	N	E	Q	T	V	G	L	V	D	D	D	G	S	V	Y	L	A	G	V	K	P	G	E	H	M	S	V	F	W	S	G	V	A	H	C	D	I	N	L	P	D	P	L	P	A	D	L	F	N	G	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?																				?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.
Sequence		L	P	C	Q	H	K	G	N	V	A	P	V	V	P	D	D	I	K	P	V	I	Q	E	Q	T	Q	Q	V	T	P	T	D	P	P	V	S	V	S	A	N	Q
Secondary structure
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Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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