Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFG6 Date Thu Jan 5 11:26:10 GMT 2012 Unique Job ID 5a6db5a5f89e6459

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	V	D	I	L	V	P	D	L	P	E	S	V	A	D	A	T	V	A	T	W	H	K	K	P	G	D	A	V	V	R	D	E	V	L	V	E	I	E	T	D	K	V	V	L	E	V	P	A	S	A	D	G	I	L	D	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	E	D	E	G	T	T	V	T	S	R	Q	I	L	G	R	L	R	E	G	N	S	A	G	K	E	T	S	A	K	S	E	E	K	A	S	T	P	A	Q	R	Q	Q	A	S	L	E	E	Q	N	N	D	A	L	S	P	A	I	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	A	E	H	N	L	D	A	S	A	I	K	G	T	G	V	G	G	R	L	T	R	E	D	V	E	K	H	L	A	K	A	P	A	K	E	S	A	P	A	A	A	A	P	A	A	Q	P	A	L	A	A	R	S	E	K	R	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?		?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	T	R	L	R	K	R	V	A	E	R	L	L	E	A	K	N	S	T	A	M	L	T	T	F	N	E	V	N	M	K	P	I	M	D	L	R	K	Q	Y	G	E	A	F	E	K	R	H	G	I	R	L	G	F	M	S	F	Y	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	V	V	E	A	L	K	R	Y	P	E	V	N	A	S	I	D	G	D	D	V	V	Y	H	N	Y	F	D	V	S	M	A	V	S	T	P	R	G	L	V	T	P	V	L	R	D	V	D	T	L	G	M	A	D	I	E	K	K	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	L	A	V	K	G	R	D	G	K	L	T	V	E	D	L	T	G	G	N	F	T	I	T	N	G	G	V	F	G	S	L	M	S	T	P	I	I	N	P	P	Q	S	A	I	L	G	M	H	A	I	K	D	R	P	M	A	V	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?				?	?	?											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
Sequence		Q	V	E	I	L	P	M	M	Y	L	A	L	S	Y	D	H	R	L	I	D	G	R	E	S	V	G	F	L	V	T	I	K	E	L	L	E	D	P	T	R	L	L	L	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand