Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P42630 Date Thu Jan 5 12:01:59 GMT 2012 Unique Job ID 5a29bc9d62e99a8c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	S	A	F	D	I	F	K	I	G	I	G	P	S	S	S	H	T	V	G	P	M	N	A	G	K	S	F	I	D	R	L	E	S	S	G	L	L	T	A	T	S	H	I	V	V	D	L	Y	G	S	L	S	L	T	G	K	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	T	D	V	A	I	I	M	G	L	A	G	N	S	P	Q	D	V	V	I	D	E	I	P	A	F	I	E	L	V	T	R	S	G	R	L	P	V	A	S	G	A	H	I	V	D	F	P	V	A	K	N	I	I	F	H	P	E	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	R	H	E	N	G	M	R	I	T	A	W	K	G	Q	E	E	L	L	S	K	T	Y	Y	S	V	G	G	G	F	I	V	E	E	E	H	F	G	L	S	H	D	V	E	T	S	V	P	Y	D	F	H	S	A	G	E	L	L	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		C	D	Y	N	G	L	S	I	S	G	L	M	M	H	N	E	L	A	L	R	S	K	A	E	I	D	A	G	F	A	R	I	W	Q	V	M	H	D	G	I	E	R	G	M	N	T	E	G	V	L	P	G	P	L	N	V	P	R	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	A	L	R	R	Q	L	V	S	S	D	N	I	S	N	D	P	M	N	V	I	D	W	I	N	M	Y	A	L	A	V	S	E	E	N	A	A	G	G	R	V	V	T	A	P	T	N	G	A	C	G	I	I	P	A	V	L	A	Y	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	K	F	R	R	P	V	N	E	R	S	I	A	R	Y	F	L	A	A	G	A	I	G	A	L	Y	K	M	N	A	S	I	S	G	A	E	V	G	C	Q	G	E	I	G	V	A	C	S	M	A	A	A	G	L	T	E	L	L	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?			?																					?					?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	P	A	Q	V	C	N	A	A	E	I	A	M	E	H	N	L	G	L	T	C	D	P	V	A	G	Q	V	Q	I	P	C	I	E	R	N	A	I	N	A	V	K	A	V	N	A	A	R	M	A	M	R	R	T	S	A	P	R	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Sequence		L	D	K	V	I	E	T	M	Y	E	T	G	K	D	M	N	D	K	Y	R	E	T	S	R	G	G	L	A	I	K	V	V	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand