Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33599 Date Thu Jan 5 11:52:22 GMT 2012 Unique Job ID 59ea08c71b61b1b6

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	D	L	T	A	Q	E	P	A	W	Q	T	R	D	H	L	D	D	P	V	I	G	E	L	R	N	R	F	G	P	D	A	F	T	V	Q	A	T	R	T	G	V	P	V	V	W	I	K	R	E	Q	L	L	E	V	G	D	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	K	L	P	K	P	Y	V	M	L	F	D	L	H	G	M	D	E	R	L	R	T	H	R	E	G	L	P	A	A	D	F	S	V	F	Y	H	L	I	S	I	D	R	N	R	D	I	M	L	K	V	A	L	A	E	N	D	L	H	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	T	F	T	K	L	F	P	N	A	N	W	Y	E	R	E	T	W	D	L	F	G	I	T	F	D	G	H	P	N	L	R	R	I	M	M	P	Q	T	W	K	G	H	P	L	R	K	D	Y	P	A	R	A	T	E	F	S	P	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	T	K	A	K	Q	D	L	E	M	E	A	L	T	F	K	P	E	E	W	G	M	K	R	G	T	E	N	E	D	F	M	F	L	N	L	G	P	N	H	P	S	A	H	G	A	F	R	I	V	L	Q	L	D	G	E	E	I	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		C	V	P	D	I	G	Y	H	H	R	G	A	E	K	M	G	E	R	Q	S	W	H	S	Y	I	P	Y	T	D	R	I	E	Y	L	G	G	C	V	N	E	M	P	Y	V	L	A	V	E	K	L	A	G	I	T	V	P	D	R	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	I	R	V	M	L	S	E	L	F	R	I	N	S	H	L	L	Y	I	S	T	F	I	Q	D	V	G	A	M	T	P	V	F	F	A	F	T	D	R	Q	K	I	Y	D	L	V	E	A	I	T	G	F	R	M	H	P	A	W	F	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	G	G	V	A	H	D	L	P	R	G	W	D	R	L	L	R	E	F	L	D	W	M	P	K	R	L	A	S	Y	E	K	A	A	L	Q	N	T	I	L	K	G	R	S	Q	G	V	A	A	Y	G	A	K	E	A	L	E	W	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	G	A	G	L	R	A	T	G	I	D	F	D	V	R	K	A	R	P	Y	S	G	Y	E	N	F	D	F	E	I	P	V	G	G	G	V	S	D	C	Y	T	R	V	M	L	K	V	E	E	L	R	Q	S	L	R	I	L	E	Q	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	N	N	M	P	E	G	P	F	K	A	D	H	P	L	T	T	P	P	P	K	E	R	T	L	Q	H	I	E	T	L	I	T	H	F	L	Q	V	S	W	G	P	V	M	P	A	N	E	S	F	Q	M	I	E	A	T	K	G	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	Y	Y	L	T	S	D	G	S	T	M	S	Y	R	T	R	V	R	T	P	S	F	A	H	L	Q	Q	I	P	A	A	I	R	G	S	L	V	S	D	L	I	V	Y	L	G	S	I	D	F	V	M	S	D	V	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																						?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand