Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76387 Date Thu Jan 5 12:22:28 GMT 2012 Unique Job ID 59d0e424657c8906

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	E	K	V	K	Q	H	A	A	P	V	T	G	S	D	E	I	D	I	G	R	L	V	G	T	V	I	E	A	R	W	W	V	I	G	I	T	T	V	F	A	L	C	A	V	V	Y	T	F	F	A	T	P	I	Y	S	A	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	V	Q	I	E	Q	N	S	G	N	S	L	V	Q	D	I	G	S	A	L	A	N	K	P	P	A	S	D	A	E	I	Q	L	I	R	S	R	L	V	L	G	K	T	V	D	D	L	D	L	D	I	A	V	S	K	N	T	F	P	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?																		?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	G	A	G	W	D	R	L	M	G	R	Q	N	E	T	V	K	V	T	T	F	N	R	P	K	E	M	A	D	Q	V	F	T	L	N	V	L	D	N	K	N	Y	T	L	S	S	D	G	G	F	S	A	R	G	Q	A	G	Q	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?							?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	K	E	G	V	T	L	M	V	E	A	I	H	A	S	P	G	S	E	F	T	V	T	K	Y	S	T	L	G	M	I	N	Q	L	Q	N	S	L	T	V	T	E	N	G	K	D	A	G	V	L	S	L	T	Y	T	G	E	D	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	I	R	D	I	L	N	S	I	A	R	N	Y	Q	E	Q	N	I	E	R	K	S	A	E	A	S	K	S	L	A	F	L	A	Q	Q	L	P	E	V	R	S	R	L	D	V	A	E	N	K	L	N	A	F	R	Q	D	K	D	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		D	L	P	L	E	A	K	A	V	L	D	S	M	V	N	I	D	A	Q	L	N	E	L	T	F	K	E	A	E	I	S	K	L	Y	T	K	V	H	P	A	Y	R	T	L	L	E	K	R	Q	A	L	E	D	E	K	A	K	L	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?												?																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	V	T	A	M	P	K	T	Q	Q	E	I	V	R	L	T	R	D	V	E	S	G	Q	Q	V	Y	M	Q	L	L	N	K	E	Q	E	L	K	I	T	E	A	S	T	V	G	D	V	R	I	V	D	P	A	I	T	Q	P	G	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																																			?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	P	K	K	G	L	I	I	L	G	A	I	I	L	G	L	M	L	S	I	V	G	V	L	L	R	S	L	F	N	R	G	I	E	S	P	Q	V	L	E	E	H	G	I	S	V	Y	A	S	I	P	L	S	E	W	Q	K	A	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	V	K	T	I	K	G	I	K	R	Y	K	Q	S	Q	L	L	A	V	G	N	P	T	D	L	A	I	E	A	I	R	S	L	R	T	S	L	H	F	A	M	M	Q	A	Q	N	N	V	L	M	M	T	G	V	S	P	S	I	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	F	V	C	A	N	L	A	A	V	I	S	Q	T	N	K	R	V	L	L	I	D	C	D	M	R	K	G	Y	T	H	E	L	L	G	T	N	N	V	N	G	L	S	E	I	L	I	G	Q	G	D	I	T	T	A	A	K	P	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		I	A	K	F	D	L	I	P	R	G	Q	V	P	P	N	P	S	E	L	L	M	S	E	R	F	A	E	L	V	N	W	A	S	K	N	Y	D	L	V	L	I	D	T	P	P	I	L	A	V	T	D	A	A	I	V	G	R	H	V	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?								?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		T	T	L	M	V	A	R	Y	A	V	N	T	L	K	E	V	E	T	S	L	S	R	F	E	Q	N	G	I	P	V	K	G	V	I	L	N	S	I	F	R	R	A	S	A	Y	Q	D	Y	G	Y	Y	E	Y	E	Y	K	S	D	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
Sequence
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand