Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P39393 Date Thu Jan 5 12:00:28 GMT 2012 Unique Job ID 59cfd90441049a96

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Y	V	N	Q	R	Q	N	C	D	C	G	S	P	V	Y	E	V	A	F	C	N	D	C	N	E	P	H	L	L	A	R	D	K	K	G	K	L	V	Q	W	E	N	K	G	G	D	E	F	S	L	Q	D	E	V	P	V	E	H	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?									?												?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	T	E	E	K	V	E	K	E	N	S	F	Q	P	P	L	I	I	A	A	G	E	T	S	E	A	G	Y	T	L	Q	R	L	D	R	Q	T	R	R	I	G	V	I	N	N	D	S	I	P	L	I	I	N	D	I	E	Q	V	C	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	S	G	C	G	Y	R	G	M	S	G	K	Q	P	F	R	R	A	L	L	G	G	P	F	Y	V	T	N	I	V	P	T	V	L	E	Y	C	Q	D	F	T	S	D	E	G	K	E	G	V	G	P	D	S	L	P	G	R	G	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?		?	?	?	?	?													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
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Sequence		L	I	T	F	T	D	S	R	Q	G	T	A	R	M	A	V	R	M	Q	Q	E	A	E	R	S	R	L	R	G	S	V	V	E	I	L	S	W	H	Q	R	T	Q	T	S	T	A	P	N	A	N	A	D	L	E	K	L	A	A	R	A
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Disorder																			?																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	Q	A	R	E	Q	A	E	E	Y	R	S	W	G	M	P	D	Q	A	K	L	S	Q	A	Q	A	E	Q	L	E	Q	A	Y	Q	A	A	T	G	G	K	A	A	T	I	L	V	S	R	T	W	T	E	M	V	N	E	L	K	E	R
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Disorder				?	?	?	?	?					?	?			?	?			?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	D	I	R	G	P	V	L	Q	Y	N	H	Y	L	K	P	E	V	F	N	E	N	G	G	P	L	K	L	S	E	M	L	L	F	R	E	F	M	R	R	P	K	R	T	N	S	L	E	T	Q	G	L	V	Q	V	G	Y	Q	G	L
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Disorder		?	?	?	?	?					?			?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	K	I	H	K	S	P	L	H	W	Q	E	K	G	L	T	L	D	D	W	R	D	F	L	K	V	T	L	D	H	Y	V	R	E	S	N	F	T	Q	L	D	D	E	L	K	N	W	I	G	S	R	F	S	S	K	F	V	R	N	P
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Disorder													?	?																																						?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	S	K	D	P	E	D	N	Q	N	R	R	W	P	Q	I	R	N	G	N	V	S	H	R	L	A	K	L	L	M	L	G	A	G	F	K	T	V	N	A	A	T	I	D	I	I	N	T	W	L	K	E	A	W	A	Q	L	T	G	P
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	A	V	L	K	P	D	G	N	R	F	Y	L	P	K	E	H	M	T	F	S	L	I	T	D	A	W	I	C	P	V	T	N	K	I	L	D	T	A	F	K	G	L	T	P	Y	L	P	T	H	I	S	F	E	H	L	T	L	A	Q
Secondary structure
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Disorder		?		?	?				?	?																																										?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Y	D	T	F	V	A	Q	K	V	T	M	P	E	I	W	K	L	D	R	S	Q	E	D	Y	A	E	G	L	A	K	A	R	D	W	V	S	H	D	P	L	I	A	Q	L	R	S	E	N	V	W	T	D	I	N	D	R	V	V	E	G
Secondary structure
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Disorder																			?		?	?	?	?	?																																			?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		G	F	Y	Y	R	T	A	E	H	S	A	Q	Q	S	S	E	R	L	Q	S	Y	E	K	M	F	K	N	G	Q	L	N	V	L	N	C	S	T	T	M	E	M	G	V	D	T	D	R	V	M	T	L	A	S	R	S	Q	Q	A	T	I
Secondary structure
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Disorder		?	?	?							?	?	?	?	?																																											?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		P	G	P	E	W	H	L	N	D	E	L	V	V	R	S	L	G	Y	K	T	V	E	L	N	E	F	I	L	P	A	K	A	T	N	A	V	E	R	V	K	D	I	Q	I	H	K	Q	L	N	G	P	L	S	Q	F	G	Q	R	F	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?		?	?			?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?				?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	V	L	F	N	D	H	E	E	A	Q	S	L	M	N	N	T	R	I	T	G	V	H	Y	T	D	R	Y	L	Q	N	P	V	A	L	A	L	L	G	S	I	L	R	P	L	K	T	K	L	T	D	G	A	E	V	T	L	D	T	L
Secondary structure
SS confidence
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Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		F	K	D	K	D	R	P	G	N	R	P	F	H	D	W	M	S	I	A	D	F	Q	D	F	A	D	Q	W	F	A	A	A	L	G	R	P	V	E	L	T	V	F	D	S	P	R	D	I	P	H	H	R	K	L	T	V	T	F	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																			?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		G	Q	V	L	K	I	R	F	D	Q	G	M	G	Y	W	R	I	N	F	S	S	Q	W	H	Y	F	D	F	R	D	D	V	S	F	Q	L	V	K	M	A	Q	A	C	K	E	G	N	V	A	N	S	E	E	S	W	A	T	D	V	L
Secondary structure
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Disorder																															?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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Sequence		V	E	V	I	A	S
Secondary structure
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