Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P23837 Date Wed Jan 25 15:20:44 GMT 2012 Unique Job ID 599fae7d759b0fd9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	K	L	L	R	L	F	F	P	L	S	L	R	V	R	F	L	L	A	T	A	A	V	V	L	V	L	S	L	A	Y	G	M	V	A	L	I	G	Y	S	V	S	F	D	K	T	T	F	R	L	L	R	G	E	S	N	L	F	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	L	A	K	W	E	N	N	K	L	H	V	E	L	P	E	N	I	D	K	Q	S	P	T	M	T	L	I	Y	D	E	N	G	Q	L	L	W	A	Q	R	D	V	P	W	L	M	K	M	I	Q	P	D	W	L	K	S	N	G	F	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?		?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?		?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	I	E	A	D	V	N	D	T	S	L	L	L	S	G	D	H	S	I	Q	Q	Q	L	Q	E	V	R	E	D	D	D	D	A	E	M	T	H	S	V	A	V	N	V	Y	P	A	T	S	R	M	P	K	L	T	I	V	V	V	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?										?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	P	V	E	L	K	S	S	Y	M	V	W	S	W	F	I	Y	V	L	S	A	N	L	L	L	V	I	P	L	L	W	V	A	A	W	W	S	L	R	P	I	E	A	L	A	K	E	V	R	E	L	E	E	H	N	R	E	L	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	A	T	T	R	E	L	T	S	L	V	R	N	L	N	R	L	L	K	S	E	R	E	R	Y	D	K	Y	R	T	T	L	T	D	L	T	H	S	L	K	T	P	L	A	V	L	Q	S	T	L	R	S	L	R	S	E	K	M	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	D	A	E	P	V	M	L	E	Q	I	S	R	I	S	Q	Q	I	G	Y	Y	L	H	R	A	S	M	R	G	G	T	L	L	S	R	E	L	H	P	V	A	P	L	L	D	N	L	T	S	A	L	N	K	V	Y	Q	R	K	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	I	S	L	D	I	S	P	E	I	S	F	V	G	E	Q	N	D	F	V	E	V	M	G	N	V	L	D	N	A	C	K	Y	C	L	E	F	V	E	I	S	A	R	Q	T	D	E	H	L	Y	I	V	V	E	D	D	G	P	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	L	S	K	R	E	V	I	F	D	R	G	Q	R	V	D	T	L	R	P	G	Q	G	V	G	L	A	V	A	R	E	I	T	E	Q	Y	E	G	K	I	V	A	G	E	S	M	L	G	G	A	R	M	E	V	I	F	G	R	Q	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?		?	?	?																																			?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.
Sequence		S	A	P	K	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand